Sci Rep:利用“博弈论”寻找细菌耐药性机制
2019年10月11日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,华盛顿州立大学的研究人员开发了一种鉴定细菌内部抗生素抗性基因的新方法。 通过使用机器学习和博弈论,研究人员能够在三种不同类型细菌中寻找抗生素抗性基因,准确度高达93%至99%。相关结果发表在最近的《Scientific Reports》杂志上,文章作者是来自电气工程和计算机科学学院的Shira Broschat教授。
研究人员揭示甲流病毒利用特殊结构进行进化的机制
甲型流感病毒的复制依赖于病毒对宿主细胞表面的粘附性,病毒的繁殖则需要子代病毒粒可以从受感染的宿主细胞中脱离并扩散到相邻的易感宿主细胞。病毒的粘附功能取决于病毒包膜上含量更为丰富的糖蛋白,血凝素(HA或H)。而病毒另一表面糖蛋白,神经胺酸酶(NA或N),其功能则是剪切宿主细胞的表面和HA粘附的分子,促使病毒从受感染的宿主细胞脱离。HA和NA同时也作为流感病毒的表面抗原,并且由于不同环境刺激,例如来自
萤火虫及其成虫生物荧光的系统进化研究取得进展
生物荧光是进化生物学最有趣的现象之一,主要用于警戒和求偶交流。因此,具有生物荧光的类群自达尔文时期就吸引着众多的生物学家,是探索新特征起源的理想研究系统之一。萤火虫是最著名的陆生发光生物,广布于世界各地,分为9个亚科、约100个属2000多个种,已发现的所有类群至少在幼虫阶段都可发光。萤火虫的一些属的有限地理分布和种群稀有性使得萤火虫的分子系统发育关系仍有诸多不确定性,这种
Cell:中性进化决定寿命和衰老
2019年8月22日讯 /生物谷BIOON /——不同的非洲鳉鱼种类的寿命有很大的不同——从几个月到几年不等。科隆马克斯·普朗克衰老生物学研究所的科学家们研究了自然界中不同的寿命是如何进化的,并发现了一种基本机制,通过这种机制,有害的突变会在基因组中累积,导致鱼类快速衰老并变得短命。在人类中,变异主要集中在老年活跃的基因中。自然界的物种在寿命上有很大的不同,从几小时就成年的蜉蝣到几百年的鲸鱼。自然
Cell:科学家发明了分子“定向进化”的快速方法
2019年8月24日讯 /生物谷BIOON /——北卡罗来纳大学医学院的科学家们创造了一种强大的新"定向进化"技术,用于快速开发科学工具和针对许多疾病的新疗法。据《Cell》杂志报道,科学家们通过进化几种蛋白质来完成精确的新任务,每次都在几天内完成,从而展示了这项技术。现有的定向进化方法更加费力和耗时,而且通常应用于细菌细胞,这限制了这种技术在人类细胞中进化蛋白质的实用性。定向进化是一种人为的、加
我国科学家揭示香蕉亚基因组进化和功能分歧
2019年7月15号,中国热带农业科学院热带生物技术研究所金志强、胡伟研究团队在Nature Plants上在线发表了题为Musa balbisiana genome reveals subgenome evolution and functional divergence的研究论文。该研究报告了一种高质量的M. balbisiana基因组装配,为理解水果生物学提供了更大的背景,并有助
酶定向进化方法学研究取得进展
定向进化技术是改造酶催化特性(如立体/区域/化学选择性、活性、热稳定性等)的有效手段。前期研究证明,对位于酶催化口袋的氨基酸残基进行饱和突变(SM)可成功控制酶的选择性和活性。作为常用的简并密码子,NNK可编码20种氨基酸,但随着突变位点的增多,筛选量呈指数级增长(20m,m为位点数目)。如何通过精简密码子设计并构建高效突变体文库,从而克服筛选瓶颈受到越来越多的关注。中国科学院天津工业生物技术研究
Bio Lett:人类的怀孕依赖于3亿年前类似鸭嘴兽的动物中进化而来的细胞
2019年7月27日讯 /生物谷BIOON/——伦敦大学学院(UCL)和耶鲁大学(Yale University)联合开展的一项研究发现,血小板细胞最早在大约3亿年前在一种类似现代鸭嘴兽的卵生动物身上进化出来。血小板细胞可以阻止哺乳动物不停地流血。这一事件是包括人类在内的哺乳动物胎盘发育起源的先决条件。这篇发表在《Biology Letters》上的评论文章,指出血小板细胞在真核哺乳动物的进化过程
Science:利用基因共同进化揭示蛋白相互作用网络
2019年7月14日讯/生物谷BIOON/---对基因组进行测序变得越来越便宜,但是对所产生的数据的理解仍然很难。如今,在一项新的研究中,来自美国华盛顿大学和哈佛大学的研究人员找到了一种从已被测序的DNA中提取有用信息的新方法。通过对细菌中成对基因之间共享的细微进化特征进行编目,他们够发现数百种之前未知的蛋白相互作用。这种方法当前正应用于人类基因组,并且可能产生关于人类蛋白如何相互作用的新见解。相
Nat Microbiol:揭示一种新型人类肠道病毒的进化机制
2019年7月12日 讯 /生物谷BIOON/ --夏天出国旅游会改变我们的眼界,同时也会改变机体的肠道结构,近日,一项刊登在国际杂志Nature Microbiology上的研究报告中,来自美国圣地亚哥州立大学的科学家们通过研究发现,一种名为crAssphage的病毒或许拥有特异性的生物标志物,当一个人从某地旅游到另外一个地方时,这种生物标志物会迅速发生变化。图片来源:San Diego Sta