Science:新研究揭示TRA2β调节T细胞命运机制
TRA2β 蛋白通过其 PE 的表达在初始T 细胞中维持在低水平。TCR诱导TRA2β-PE跳跃后,TRA2β蛋白的表达增加,使其能够调节TCR信号传导基因的选择性剪接,促进效应T细胞的分化。
2024-09-22
Nat Cell Biol:赵方庆团队开发基于编程控制的转录组实时测序新技术
该研究首次提出了转录组智能测序的概念,依托人工智能纳米孔自适应测序算法,能够实时判断测序分子来源,并可编程选择目标测序分子进行全长测序。
2024-11-03
Cell Rep:刘行/姚雪彪/王志凯合作揭示细胞更新转录调控新机制
该研究发现了书签标识因子FOXA1在细胞有丝分裂期过程中DNA结合模式转变的磷酸化调控机制,以及FOXA1转录凝聚体的形成与功能发挥的分子基础。
2024-09-22
Mol Cell:HOXDeRNA 通过与基因组广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子
HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域,从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制,最终激活多个癌症驱动基因,驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。
2024-11-07
Cell Metab:吕德官等揭示胶质母细胞瘤中调控表观转录的关键代谢途径
该发现揭示了MDH2是维持GSCs代谢和表观转录组网络的关键环节,为开发更为有效的靶向治疗方案铺平了道路。
2024-11-06
Nature Genetics:赵方庆团队开发高通量三维空间转录组新技术
MAGIC-seq提出了“拼接芯片”的概念,即通过调整网格间距和多轮编码的方式将多个捕获网格拼接在一起,突破了传统微流控方法的通道限制,实现了高分辨率与大视野的兼顾。
2024-09-13
Nature Methods | 全面评估长读长RNA测序:揭示转录组分析新前沿
LRGASP项目通过系统评估多种长读长RNA测序技术和分析工具,提供了对当前最佳实践的深入理解和未来改进的方向。
2024-06-12
研究揭示拟南芥孤儿基因调节花粉发育的分子机制
中国科学院西双版纳热带植物园植物基因组演化与次生代谢研究组发现,ICE1作为关键的转录激活因子,正向调节QQS的表达,以提高花粉的萌发和活力。
2024-07-18
科研人员开发基于深度学习模型的空间转录组精细分辨率细胞注释算法
STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具,在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。
2024-11-10
Science:虚拟筛选发现钙敏感受体的正向变构调节分子
这是首次通过实验对比超大分子库(12亿分子)与传统分子库(270万分子)的有效性。实验表明,超大分子库在发现PAMs时,不仅数量更多,而且这些PAMs的活性更强。
2024-10-13