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Nature Communications:研究发表单细胞转录组数据检索新方法和参考数据库

 作为细胞异质性研究的重要工具,单细胞转录组测序技术近年来蓬勃发展,并积累了大量研究数据。若能有效利用现有的单细胞数据进行检索与推断,研究者便能更好地进行新测序单细胞的注释,以及综合多数据集的研究。然而,精确的单细胞转录组数据检索和注释需要克服两个挑战:一、数据集之间的批次效应(batch effect)会显着影响细胞检索的可靠性;二、目前缺少跨物

2020-07-15

研究获得青鳉胚胎发育过程中的转录及调控动态图谱

 青鳉(Oryzias latipes)是一种重要的脊椎动物模型,已经在遗传学、发育生物学以及环境科学等领域广泛应用。目前,青鳉已有高质量的基因组序列,以及大量可用的遗传学技术手段。然而,目前的青鳉基因组注释主要是基于生物信息学预测和短读长的转录组测序数据,仍然存在很多问题。低质量的基因组注释是利用青鳉作为模式动物进行组学和系统生物学研究的重要障碍

2020-07-07

PNAS:识别特定类型短糖链的CAR-T细胞有望治疗一系列实体瘤

2020年7月6日讯/生物谷BIOON/---一种称为CAR-T细胞疗法的方法已经成功地用于治疗淋巴瘤和白血病等血癌患者。它通过添加一种能识别癌细胞表面独特特征的抗体片段来对患者自身的T细胞进行基因改造。在一项新的研究中,来自美国伊利诺伊大学厄本那香槟分校、芝加哥大学和丹麦哥本哈根大学的研究人员报道,他们极大地拓宽了这种方法的潜在靶标:他们的经过基因改造的T

2020-07-06

BioNanoScience:光动力疗法有助于治疗各类型癌症

光动力疗法(PDT)是治疗局部肿瘤的最有前途的方法之一。 PDT可作为独立方法或与传统类型的治疗方法(外科手术,放射线和化学疗法)结合使用,在几乎所有的肿瘤部位进行治疗。根据肿瘤生长的阶段,性质和形式,目前已经开发了各种激光照射选择以增加光动力疗法的有效性。

2020-06-09

R环结构或能与转录因子Sox2协调作用来调节细胞重编程的多能性

2020年6月14日 讯 /生物谷BIOON/ --R环(R-loops)细胞中的特殊结构,其由RNA-DNA杂交体和可被取代的单链DNA组成,通常在转录基因附近被发现,然而,R环通常也是一种动态和广泛的实体结构,其在基因组中扮演着并不明确的调节和表观遗传角色。图片来源:CC0 Public Domain近日,一项刊登在国际杂志Science Advance

2020-06-14

研究揭示拟南芥DOF转录因子CDF4加快叶片衰老和花器脱落的新机制

 6月2日,国际学术期刊EMBO Reports 在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心蔡伟明研究组题为Transcription factor CDF4 promotes leaf senescence and floral organ abscission by regulating abscisic acid and reactive

2020-06-05

Frontiers in Pharmacology:新型小分子能够影响转录调控过程

近日,根据Insilico Medicine在《Frontiers in Pharmacology》杂志上发表的名为“Molecular Generation for Desired Transcriptome Changes With Adversarial Autoencoders”的新研究论文,首次针对特定的转录反应创建了靶向性的分子结构用于调节其活性。

2020-05-21

研究人员利用RNA编辑策略实现对逆转录转座子的编辑干预

 5月19日,Cell Discovery 在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所研究员郝沛利用RNA编辑策略、编辑干预逆转录转座子的合作研究论文:Interfering with retrotransposition by two types of CRISPR effectors: Cas12a and Cas13a。该研究利用逆转录病毒/逆转录

2020-05-22

elife:研究揭示不同类型血栓形成的原因

根据最近在《eLife》上发表的一项研究,一种新开发的工具能够根据导致血液凝块的原因来区分不同类型的血液凝块。

2020-05-13

“拟南芥转录因子基因BP在调控植物种子萌发中的应用”获发明专利

 拟南芥又名鼠耳芥、阿拉伯芥、阿拉伯草,拉丁文名为Arabidopsis thaliala (L.) Heynh。拟南芥作为一种草本植物广泛分布于欧亚大陆和非洲西北部。在我国的内蒙、新疆、陕西、甘肃、西藏、山东、江苏、安徽、湖北、四川、云南等省区均有生长。拟南芥植株较小(一个8cm见方的培养钵可种植4-10株)、生长周期短(从发芽到开花约4-6周)

2020-05-16