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综述:实体瘤空间转录组分析的新见解

空间和时间动力学与细胞生命周期的所有特性密切相关,包括细胞发生、分化、功能和死亡。

2023-10-26

科研人员解析出叶绿体基因转录蛋白质机器构造

该研究解析了叶绿体基因转录蛋白质机器的冷冻电镜结构,揭示了叶绿体基因转录蛋白质机器的“装配部件”、“装配模式”和“功能模块”。

2024-03-02

单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21

Nature子刊:诸颖团队开发空间转录组语义注释新算法Pianno

在这项研究中,研究团队展示了Pianno在注释各种形状的解剖结构以及病灶和细胞类型方面的卓越性能,这些数据来自不同的空间技术平台。

2024-04-10

Nature:揭示组蛋白修饰调节先锋转录因子协同性结合机制

就像紧紧缠绕在线轴上的线一样,DNA被包裹在组蛋白上,并被包装成称为核小体的结构。在一项新的研究中,来自美国圣犹达儿童研究医院的研究人员探索了一种被称为先锋转录因子(pioneer transcrip

2023-05-30

科研人员描绘小鼠胆汁淤积损伤与再生的时空转录图谱

该研究利用高精度大视场时空组学Stereo-seq和单细胞转录组测序技术DNBelab C4,系统描绘了小鼠胆汁淤积损伤与再生的时空转录图谱。

2024-04-18

研究揭示增强子-启动子通讯调控转录爆发的基本原理

近日,中山大学数学学院张家军教授团队开发了一个通用的理论框架,该框架整合了快时间尺度上的染色质空间运动和慢时间尺度上的基因转录爆发过程。

2024-03-16

Nature Communications: SOXC是成人骨量的关键调节因子

来自费城儿童医院的研究者们揭示了SOXC是成人骨量的关键调节因子。

2024-04-12

科研人员开发表观转录组数据聚类框架iMVP

iMVP的开发为RNA编辑修饰研究带来了新的可能性,为科研人员提供了一个更全面、更有效的工具,有望有助于更深入地理解RNA编辑修饰的复杂性和功能。

2023-10-13

科研人员开发uCoTargetX技术实现单细胞多组蛋白修饰与转录并行检测

研究者在此基础上进一步优化革新,发展了uCoTargetX技术,在国际上率先实现单细胞多种组蛋白修饰和转录组的并行检测,为深入研究各种生理病理状态下细胞命运的表观调控提供了强有力的技术工具。

2024-01-16