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研究人员预测和设计揭示无序蛋白结构域的靶标识别机制

中国科大刘海燕教授、陈泉教授课题组与复旦大学王文宁教授合作,采用蛋白质结构预测、序列设计等计算手段与蛋白质互补分析和深度突变扫描、X射线晶体学、NMR等实验结合的方法,揭示了固有无序的4.1G蛋白C端

2023-10-07

研究人员建立定量测定离子束对细胞切片中蛋白质的损伤新方法

较体外纯化的蛋白质,在细胞中处于工作状态的蛋白质机器具有更为完整和生理的构象。因此,在细胞环境中直接对蛋白质机器进行三维结构解析是结构生物学的下一个目标,也是冷冻电镜技术发展的前沿。而利用冷冻电镜研究

2023-08-25

Science重磅:AI设计蛋白新突破,David Baker团队设计出响应刺激的双态铰链蛋白

总的来说,这项新研究开发出了同时具有两种明确状态的铰链蛋白,可以应用于“蛋白质开关”的设计。这种双态开关的研究能使蛋白质设计超越静态结构,转向更复杂的多态组装和生物传感器设计,为蛋白设计提供了更广阔的

2023-08-22

研究发现全新蛋白质修饰类型

细胞代谢为生命过程提供能量。同时,代谢物可共价修饰蛋白质来发挥信号传导功能。虽然许多代谢物在代谢通路中的作用广为人知,但它们介导细胞信号调控的功能有待探索。酮体(包括丙酮、乙酰乙酸和β-羟基

2023-07-06

Cell子刊:邹鹏团队报道基于荧光成像的蛋白质定向进化方法

由于Faculae方法能够在哺乳动物细胞中高效构建突变体文库,并在显微镜下鉴定细胞表型并快速选择细胞,该方法为进化荧光探针、化学遗传学元件和光遗传学元件等蛋白质工具提供了新思路。

2023-08-07

研究人员发布蛋白质-纳米材料界面相互作用的结构质谱表征实验手册

近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子结构表征新方法研究组研究员王方军团队发布了表征蛋白质-纳米材料界面相互作用精细结构的赖氨酸反应性分析-质谱(LRP-MS)实验手册。

2023-08-16

Advanced Science:赵英明/黄河等揭示全新蛋白质修饰类型

细胞代谢为生命过程提供能量,同时,代谢物可共价修饰蛋白质来发挥信号传导功能。虽然许多代谢物在代谢通路中的作用广为人知,但它们介导细胞信号调控的功能有待探索。

2023-07-10

EMBO Reports封面论文:王磊/刘光慧合作揭示蛋白质氧化折叠在干细胞衰老中的作用

研究团队发现,作为参与蛋白质氧化折叠的关键分子蛋白质二硫键异构酶PDI,在多种人体细胞衰老模型和老年小鼠组织中均表达上调,敲除PDI能够降低蛋白质氧化折叠速率,延缓干细胞的衰老。

2023-08-07

科研人员开发基因编码的光控蛋白质标记新技术

邹鹏课题组利用RinID技术系统研究了多个亚细胞区域的蛋白质组,包括线粒体、内质网、细胞核等,均获得了出色的空间特异性(>90%),高于目前常用的APEX2、TurboID等技术。

2023-07-11

MIT团队提出蛋白生成新模型,无需预训练,可从头生成新蛋白质,主链长度可达500个氨基酸序列

近日,麻省理工学院的研究人员开发出了一种扩散模型 FrameDiff,这是一种生成式深度学习工具,能够生成自然界中不存在的新型蛋白质结构。在研究中,研究团队将 FrameDiff 应用于蛋白质主链生成

2023-07-24