MIT团队提出蛋白生成新模型，无需预训练，可从头生成新蛋白质，主链长度可达500个氨基酸序列
近日，麻省理工学院的研究人员开发出了一种扩散模型 FrameDiff，这是一种生成式深度学习工具，能够生成自然界中不存在的新型蛋白质结构。在研究中，研究团队将 FrameDiff 应用于蛋白质主链生成
2023-07-24
Cell：利用TransitID动态绘制活细胞内和活细胞间的蛋白质组转运
我们DNA中的遗传计划通过蛋白实现了功能，而蛋白是我们身体结构和活动的基础。然而，蛋白质组---细胞或特定区域内的所有蛋白---仍然是相对神秘的，因为蛋白景观是非常复杂的。例如，人类制造了数以万计的不
2023-07-09
Cell：开发新型邻近蛋白质组学技术，第一作者秦为已回国加盟清华大学
大城市内的地铁线路错综复杂，每天不同的人会从一个站点通勤到另一个站点，承担着自己的社会责任。细胞内的蛋白质在时间和空间等维度上也是高度动态的，很多蛋白会在不同的细胞器之间甚至是不同的细胞之间进行转运和
2023-07-03
麻省理工团队开发类ChatGPT模型，基于蛋白质大语言模型，加速AI药物发现
开展一个药物筛选项目就像举办一场大型酒会，并旁听和记录整个过程。在酒会上的绝大多数交流只是闲聊，有意义的谈话只占极少数。药物筛选同样如此，微弱的药物靶标相互作用远超高亲和力的结合。
2023-06-16
Nature：揭示组蛋白修饰调节先锋转录因子协同性结合机制
就像紧紧缠绕在线轴上的线一样，DNA被包裹在组蛋白上，并被包装成称为核小体的结构。在一项新的研究中，来自美国圣犹达儿童研究医院的研究人员探索了一种被称为先锋转录因子（pioneer transcrip
2023-05-30
Nature子刊：杨弋团队开发出活细胞蛋白质光遗传学控制技术
该研究随后利用SULI调控酵母细胞内源蛋白SicI的稳定性，实现酵母细胞周期的精确控制。此外，SULI还可用于调控斑马鱼中蛋白质的稳定性，通过对Pitx2蛋白稳定性的调控
2023-05-03
Nature：新研究解析出参与基因组编辑蛋白质的3D结构
在一项新的研究中，该团队发现了一种名为TnpB的蛋白的三维结构，它可能是CRISPR-Cas12酶的前体。相关研究结果发表在2023年4月13日的Nature期刊上。
2023-04-27
Dev Cell：张宏团队揭示蛋白质能以“表面活性剂”方式调控基因转录
该研究表明转录因子凝聚体的界面张力与其转录活性密切相关，细胞中的天然蛋白质可能以表面活性剂方式调控转录因子凝聚体的界面张力及转录活性，进而调控相关通路的活性。
2023-05-01