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AI蛋白设计再登Nature:Diffusion模型助力更强的蛋白质从头设计

该研究开发了蛋白质从头设计的深度学习算法——Family-wide Hallucination,并通过实验室测试证实,这些自然界中不存在的人造酶可以非常有效地催化荧光素底物发光。这是科学界首次基于深度

2023-07-14

研究人员发布蛋白质-纳米材料界面相互作用的结构质谱表征实验手册

近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子结构表征新方法研究组研究员王方军团队发布了表征蛋白质-纳米材料界面相互作用精细结构的赖氨酸反应性分析-质谱(LRP-MS)实验手册。

2023-08-16

单结构域蛋白质索烃的设计和合成方面取得重要进展

以对蛋白质进行环化、索烃化、打结等拓扑改造为代表的蛋白质拓扑工程是一种重要的调控蛋白质性质的手段。近年来,基于可基因编码的蛋白质缠结基元和反应基元的“组装-反应协同”理念,发展

2023-07-26

Advanced Science:赵英明/黄河等揭示全新蛋白质修饰类型

细胞代谢为生命过程提供能量,同时,代谢物可共价修饰蛋白质来发挥信号传导功能。虽然许多代谢物在代谢通路中的作用广为人知,但它们介导细胞信号调控的功能有待探索。

2023-07-10

Nature子刊:刘聪/李丹合作建立化学小分子与淀粉样蛋白聚集体基本理论

该研究首次构建了蛋白淀粉样聚集态下小分子配体-蛋白质互作的基本原理,为基于结构开发能够特异识别蛋白聚集体的小分子示踪剂提供了重要的理论支持和技术平台。

2023-07-13

科研人员开发基因编码的光控蛋白质标记新技术

邹鹏课题组利用RinID技术系统研究了多个亚细胞区域的蛋白质组,包括线粒体、内质网、细胞核等,均获得了出色的空间特异性(>90%),高于目前常用的APEX2、TurboID等技术。

2023-07-11

EMBO Reports封面论文:王磊/刘光慧合作揭示蛋白质氧化折叠在干细胞衰老中的作用

研究团队发现,作为参与蛋白质氧化折叠的关键分子蛋白质二硫键异构酶PDI,在多种人体细胞衰老模型和老年小鼠组织中均表达上调,敲除PDI能够降低蛋白质氧化折叠速率,延缓干细胞的衰老。

2023-08-07

哈佛教授捐赠2.1亿美元用于蛋白质创新研究,计划加速蛋白质和抗体发现

官方新闻稿中指出,这笔捐赠将进一步支持蛋白质创新研究所的发展,以利用新的蛋白质工具和专业知识转变生物医学研究。

2023-06-05

Nature子刊:陈小华/谭敏佳团队开发时空动态的蛋白质-DNA全景解析新方法

该项研究为全局性深度解析蛋白质-DNA的时空动态互作提供了一种新方法,以目标DNA序列为探针的互作蛋白质结合活性分析策略,有望用于解析目标DNA序列中不同的碱基修饰与蛋白质相互作用的研究

2023-05-06

MIT团队提出蛋白生成新模型,无需预训练,可从头生成新蛋白质,主链长度可达500个氨基酸序列

近日,麻省理工学院的研究人员开发出了一种扩散模型 FrameDiff,这是一种生成式深度学习工具,能够生成自然界中不存在的新型蛋白质结构。在研究中,研究团队将 FrameDiff 应用于蛋白质主链生成

2023-07-24