卤键对蛋白质结构稳定性及其与多肽结合影响的计算研究获得进展
在自然界中,一些蛋白质和肽类化合物也含有卤素原子,而卤代蛋白质和卤代肽类化合物的合成也是科研人员关注的一个领域,但目前仍然缺乏对卤代蛋白质或肽所形成的卤键的系统研究。
2024-05-03
Nat Chem Biol : 魏文胜团队实现蛋白质组中丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸位点的功能解析
氨基酸是组成蛋白质的基本单位,其突变可以通过多种方式影响蛋白质功能,进而影响细胞生存和多种疾病的发生发展。此前研究已证明,使用碱基编辑器进行内源性氨基酸替换,并结合细胞筛选来大规模研究其功能的可行性
2024-10-09
EMBO J:揭示TRP14是细胞内半胱氨酸还原的限速酶,调节蛋白质组半胱氨酸化
长期以来,TRP14一直没有明确的功能。本项研究不仅明确了它在半胱氨酸代谢中的作用,还有助于解释它在不同物种间的进化保守性。
2024-07-08
Nature子刊:北京大学陈鹏团队开发相分离体系中蛋白质互作的时空特异性光交联技术
该研究巧妙地融合了空间特异的蛋白质标记技术与凝聚增强的代谢光交联探针,开发了一种高效且普适的时空特异光交联技术——DenseMAP。
2024-11-17
Nature子刊:赵英明/张迪团队等开发区分蛋白质乳酰化修饰同分异构体的新方法
该研究不仅开发了一套区分蛋白质翻译后修饰(PTM)异构体的创新方法,而且揭示了KL-la作为细胞对糖酵解和Warburg效应的主要响应者的关键角色。
2024-07-21
Mol Psych:科学家开发出能测定神经元中蛋白质表达的特定方法
本文研究中,研究人员报道了意想不到的细胞类型特异性的突触蛋白的亚型(异构体)表达,其或许在突触病变中指定突触多样性和选择性的突触功能障碍中发挥着关键的因果作用。
2024-04-12
蛋白质设计迎来“智能生成时代”
2023年以来,智能大模型成为一个热词,也成为赋能各个行业的一个重要工具。而生物科学作为可高度数字化的系统,具备可解读、可编程的特性,成为智能大模型赋能的一个重要领域。
2023-12-18
Nature Methods:蛋白质相互作用的全新探索——高分辨率交联质谱(XL-MS)标准的建立与应用前景
交联质谱(Cross-Linking Mass Spectrometry, XL-MS)因其可以提供高分辨率的结构信息,在蛋白质相互作用研究中发挥了重要作用。
2024-11-12