研究揭示疾病突变对蛋白质相互作用的综合影响
来源:科学网 2021-02-14 08:47
美国哈佛医学院Joseph Loscalzo研究小组揭示了疾病突变对蛋白质相互作用的综合影响。近日,《自然—遗传学》杂志在线发表了这项成果。研究人员表明,与疾病相关的种系变体相比,从项目1000 Genomes和ExAC的健康参与者中鉴定出的变体在编码蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)接口的序列中显著富集。与10,861个肿瘤外显子组中的非接口相比,PPI接口
美国哈佛医学院Joseph Loscalzo研究小组揭示了疾病突变对蛋白质相互作用的综合影响。近日,《自然—遗传学》杂志在线发表了这项成果。
研究人员表明,与疾病相关的种系变体相比,从项目1000 Genomes和ExAC的健康参与者中鉴定出的变体在编码蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)接口的序列中显著富集。与10,861个肿瘤外显子组中的非接口相比,PPI接口中的体细胞错义突变也显著富集。研究人员在全癌分析中通过计算确定了470种可能的oncoPPI,并证明oncoPPI与患者生存率和耐药性/敏感性高度相关。
研究人员使用系统性二元相互作用实验性地验证了13 oncoPPI的网络效应,并且还证明了其中的两个对肿瘤细胞生长的功能影响。
总而言之,这种人类相互作用组网络框架为区分具有PPI干扰突变的等位基因提供了一个有力的工具,从而可促进基于病理生物学机制和基因型的疗法发现。
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