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Nature Communications:结合深度学习和分子动力学模拟探索蛋白质的长程相互作用模式和酶活性

该方法首次将深度学习的图神经网络(GNN)运用于分子动力学模拟分析。

2022-05-22

Theranostics: 模拟微生物与肿瘤微环境的相互作用开发肿瘤治疗药物

据报道,癌症是导致死亡的主要原因之一,也是21世纪折磨全球生活质量的疾病。由于其诊断和治疗仍然具有挑战性,因此一直存在紧迫感。

2022-05-05

南京农业大学平继辉团队综述病毒-宿主相互作用网络作为甲流和新冠的新抗病毒药物靶点

病毒复制周期由蛋白质、非编码 RNA、糖类、脂类、激素和无机盐共同调控。

2022-05-05

Osteo & Cartil:揭示机体软骨与关节之间发生相互作用的分子机制

来自佛罗里达大学等机构的科学家们通过研究利用先进光子源(APS)的超亮X射线束首次在那么尺度上对软骨的移动进行了直接测定,利用这种名为X射线光子相关光谱(XPCS,X-ray photon correlation spectroscopy)的新型技术或能帮助研究人员深入阐明软骨的力学机制,并为开发治疗从常见的骨科相关疾病到运动损伤的新型疗法奠定了一定的基础。

2022-03-21

Nature Genetics:科学家揭示基因和饮食对宿主-微生物相互作用和疾病发生的影响

人类遗传变异通过环境和宿主因素的复杂组合影响肠道微生物群。人胃肠道微生物与生理之间的微妙相互作用可以影响发育和健康的多个方面,或引发疾病。越来越多的证据表明人类基因变异影响其肠道菌群组成和调节。此外,参与免疫和代谢过程以及疾病的基因也与肠道微生物的变异有关,而个体肠道微生物群在很大程度上受饮食和药物等环境变量的影响。近日,发表在Nat Genet上的一篇题为

2022-03-23

Molecular Cancer: LncRNA MIR100HG与hnRNPA2B1相互作用促进结直肠癌进展

上皮向间充质转化(EMT)是一个与肿瘤转移和耐药相关的过程,其中非编码RNA(NcRNAs)起着关键作用。研究者先前的研究表明,miR-100和miR-125b嵌入ncRNA宿主基因MIR100HG的第三内含子,在结直肠癌(CRC)中对抗表皮生长因子受体(EGFR)单抗西妥昔单抗具有耐药性。然而,MIR100HG转录本本身是否在西妥昔单抗耐药或EMT中起作用尚不清楚。

2022-03-25

Developmental Cell:揭示RNA结合蛋白相分离在植物热胁迫应答中的作用

  近日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心植物逆境生物学研究中心植物分子遗传国家重点实验室张蘅研究组与中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心刘聪研究组合作,揭示两个保守RNA结合蛋白质RBGD2(RNA-binding glycine-rich group D 2)、RBGD4通过独特的酪氨酸阵列(Tyr residue a

2022-03-11

对N6 -甲基腺苷修饰和环状RNA相互作用的新见解

作为真核生物中最常见的RNA修饰类型,N6 -甲基腺苷(m6A)可以调节RNA的加工、剪接、成熟、输出、稳定性、翻译和降解等功能。环状RNA (circRNAs)是一种新型的非编码RNA (ncRNAs),具有共价闭环结构,在多种生理和病理过程中发挥着重要作用。

2022-03-07

Nature Communications:发现糖尿病新靶点CREB/CRTC2蛋白-蛋白相互作用抑制剂先导化合物

目前,传统糖尿病药物对于空腹血糖降低效果不佳。肝糖异生作用的异常活跃是导致糖尿病患者血糖水平持续较高的原因之一,更是患者出现空腹高血糖的主要元凶。肝脏中关键的CREB/CRTC2转录复合物介导的肝糖异生作用是机体血糖升高的途径之一。CREB/CRTC2蛋白-蛋白相互作用抑制剂可调控下游糖异生相关基因的表达,通过抑制糖异生降低空腹血糖。中国科学院上海药物研究所

2022-01-15

与哺乳动物肠道病毒的相互作用改变共生菌的外膜囊泡的产生和含量

肠道共生菌有助于维持肠道内环境的稳定。破坏共生菌群与疾病的发展和持久性有关。肠道病毒利用共生菌加强病毒感染的广泛能力进一步证明了这些微生物的重要性。

2022-01-26