Nature Genetics | BANKSY:革命性算法,重塑空间组学数据分析
随着生物技术的快速发展,空间组学数据的产出呈现爆炸式增长,传统的数据分析方法已难以满足研究的需求。BANKSY算法的开发旨在解决这一问题。
【报名倒计时】2024空间多维组学创新转化研讨会,4月12日上海开幕!
“2024空间多维组学创新转化研讨会”,将于4月12日在上海召开!诚邀国内多位科学家、临床专家和行业专家分享各自领域的空间多组学应用及研究进展,探讨与推动医学领域的创新转化。
Mol Cancer | 上海交通大学齐峰等团队合作通过基于共生微生物组的多组学分子分型预测乳腺癌的分子特征和治疗反应
每年全球约有3.3亿台手术正在进行中,随着手术需求的不断增加和等待名单的延长,AI在优化外科手术流程和提高手术效果方面的潜力正逐步显现。
Nat Microbiol | 微生物世界的新视角:microbeMASST质谱工具揭示微生物代谢网络
microbeMASST相比其他质谱搜索工具的最大创新之处在于其独特的数据库架构和搜索算法。
Cell:DNA引导的转录因子协同作用塑造了面部和肢体间充质
近段时间,来自斯坦福大学化学与系统生物学系的Seungsoo Kim教授及其团队通过比较人类和黑猩猩面部颅神经嵴细胞的增强子图谱,发现了其增减与增强子活性变化相关的图案,研究TF 协同结合的功能影响。
Cell Host & Micro:纤维、基因和肠道微生物组?科学家揭示人类炎性肠病的潜在诱发因子
本文研究发现为科学家们治疗炎性肠病提供了一条潜在的新途径,通过定制特定的膳食干预措施来影响机体肠道微生物组的功能,研究人员或许就有望操控这些细菌群落来减缓机体的炎症水平。
Science:在单分子水平上直接观察与蛋白和脂质结合的聚糖的序列和位置
在一项新的研究中,来自德国马克斯-普朗克固体研究所、图宾根大学和丹麦哥本哈根大学的研究人员报告了一种在单分子水平上拍摄与几种生物分子结合的聚糖(glycan)---又称多糖---的序列和位置的方法。
单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。
BJH:科学家发现基因组修饰药物针对恶性血液疾病治疗敏感性的关键
本文研究为阐明疾病不断发展的DNA甲基化架构提供了全面的视图,或有望进一步帮助研究人员理解低甲基化药物在治疗骨髓增生异常综合征上的巨大潜力。
科研人员揭示染色质修饰感知细胞能量代谢水平控制植物环境适应性的表观调控机制
在本研究发现ADA2赖氨酸乙酰化,控制其蛋白在细胞中的积累水平,影响组蛋白乙酰转移酶活性,是感知植物在不同生长条件下细胞能量水平的变化调控染色质修饰动态平衡和基因表达的机制。