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Science:从结构上揭示MKK6-p38α复合物激活机制

细胞持续暴露于病原体等应激源,可能会扰乱生物的正常功能。为了对抗应激,细胞产生了多种应对机制,包括炎症反应。虽然炎症反应是必要的,但过多的炎症反应会损害细胞和器官的功能。细胞因子风暴就是这种情况---

2023-09-26

Cancer Cell:科学家开发出有望揭示机体免疫学特性的“质组蓝图”

来自哈佛医学院等机构的科学家们通过研究开发了一种新方法能同时检测人类免疫系统中向T细胞展示的数千种脂质分子。

2023-09-28

Nature子刊:百图生科宋乐团队开发新型蛋白质结构预测工具,不依赖多序列对比,效率更高

与基于MSA的的主流蛋白质结构预测工具AlphaFold2和RoseTTAFold方法相比,HelixFold-Single在预测效率上具有很大优势,耗时要少得多,可以应用于需要大量预测的蛋白质相关任

2023-10-17

Nature:利用新开发的 Foldseek Cluster算法一次性分析大量的蛋白结构

在一项新的研究中,来自瑞士苏黎世联邦理工学院、瑞士生物信息学研究所和韩国首尔国立大学等研究机构的研究人员通过开发一种有效的方法来比较 AlphaFold 数据库中的所有预测蛋白结构,揭示了不同物种蛋白

2023-09-27

Nature子刊:复旦大学马剑鹏团队开发智能算法,大幅提升冷冻电镜蛋白结构解析分辨率

作为蛋白质结构预测领域顶尖团队,由诺贝尔奖得主 Micheal Levitt 教授和马剑鹏教授领导的复旦大学复杂体系多尺度研究院,聚焦基础科学、交叉学科及源头底层技术,致力于推动生物大分子结构实验测定

2023-10-13

上海交大邓子新团队受邀撰写NPR封面文章——迭代式Ⅰ型聚酮合酶的结构酶学

尽管在近20年里,人们对于type I iPKSs的研究取得了长足的进展,但其复杂多变的编程式催化现象依然难以预测。然而,基于人工智能的Alphafold2

2023-10-03

Nature:揭示对大脑发育和功能至关重要的A型GABA受体在天然状态下的三维结构

在一项新的研究中,来自美国俄勒冈健康与科学大学的研究人员揭示了一种对大脑发育和功能至关重要的受体---A型GABA受体(Type A GABA receptor)---的分子结构。相关研究结果于202

2023-09-30

研究揭示异常剪切体蛋白结构

交我算团队专注于提供学科融合服务,帮助全校课题组有效利用高性能计算、AI计算和云计算等强大计算资源。团队由30多人组成,来自物理、化学、生物、材料等多个学科,致力于全校科研计算交叉与创新。

2023-08-14

PNAS:科学家识别出特殊的质血管“邮政编码”

来自罗格斯大学医学院等机构的科学家们通过研究在肺部中发现了首个脂质血管“邮政编码”(ZIP code),将药物送到人体所需要的地方是成功治疗包括癌症在内的多种疾病以及避免毒性副作用的关键。

2023-08-22

Science:我国科学家从结构上揭示CAF-1参与核小体组装机制

细胞分裂过程中的染色质遗传涉及 DNA 的复制和核小体在复制的 DNA 上的组装,因为 DNA 复制叉的通过会破坏 DNA 上的核小体。这种DNA复制偶联的核小体组装(DNA replication-

2023-09-08