Cell宏基因组揭秘：食物中的神秘微生物如何塑造我们的肠道健康
研究者总共分析了来自50个国家的2533个与食品相关的宏基因组，其中包括1950个新测序的宏基因组。这些宏基因组来自各种类型的食物，其中65%是乳制品，17%是发酵饮料，5%是发酵肉类。
2024-09-23
Cell：利用人工智能确定对人体健康至关重要的一组肠道微生物
通过在临床环境中应用这种两个相互竞争的细菌群体模型，他们的目标是将他们的研究成果转化为实用的治疗方法，从而显著改善针对以前被认为不可逆转的疾病的治疗效果。
2024-10-28
Cell Genomics：刘琦/严钢团队开发TCR和T细胞转录组跨模态整合分析的AI框架——UniTCR
UniTCR提出了一种低质跨模态场景下的免疫组学有效整合和表征的AI框架，以赋能诸多免疫数字解码相关的下游任务分析。
2024-05-06
Cell Res | 张岩课题组揭示蛋白酶激活受体的栓配体结合和激活机制及G蛋白选择性的结构基础
本研究利用单颗粒冷冻电镜技术分别解析了栓配体激活的人源PAR1受体与下游Gq蛋白及Gi蛋白复合物的高分辨电镜结构，分辨率分别为3.0埃和3.2埃。
2024-07-18
Cell：开发出一种称为 Open-ST 的空间转录组学平台，能够三维重建组织内细胞中的基因表达
Open-ST 提供了一种高性价比、高分辨率、易于使用的方法，可同时捕捉组织切片的组织形态和空间转录组学信息。连续的二维图谱可以对齐，可将组织重建为三维“虚拟组织块”。
2024-07-15
Nature Genetics | 揭示肺纤维化新视界：从小鼠到人的空间转录组学描绘特发性肺纤维化（IPF）病理机制
该研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，详细描绘了IPF和小鼠肺纤维化模型中的细胞相互作用和信号传导途径，揭示了关键的趋同和分歧路径。
2024-07-04
Cell：我国科学家开展的大规模研究揭示了DNA转座子的功能多样性，扩展了基因组工程工具箱
这项新研究新发现的转座子具有多种功能特征，极大地扩展了基于DNA转座子的基因工程工具箱，支持一系列应用场景。
2024-07-19
Nature Genetics | BANKSY：革命性算法，重塑空间组学数据分析
随着生物技术的快速发展，空间组学数据的产出呈现爆炸式增长，传统的数据分析方法已难以满足研究的需求。BANKSY算法的开发旨在解决这一问题。
2024-03-05
Science：科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型
研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序，当分析了数以万计已知的人类启动子数据后，这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成，即基序、启动子和三核苷酸（trinucleotides）。
2024-05-27