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中山大学生命科学学院RNA组学团队开发PolⅢ转录的非编码RNA功能网络信息库

中山大学生命科学学院RNA组学团队杨建华教授等开发了Pol3Base数据和信息库,系统鉴定RNA聚合酶III(PolⅢ)转录的非编码RNA(P3RNA),全面解析P3RNA的互作组、表达、进化、表观转录组、疾病变异及调控网络。Pol3Base 网站整合了由不同转录因子调控的数千个 RNA 聚合酶 III 转录的 ncRNAs 转录组数据。Pol3Base 的

2022-01-02

CircRNA-miRNA-mRNA相互作用网络在糖尿病及其相关并发症中的作用

大多数非蛋白质编码的RNA被鉴定为具有参与细胞内稳态的多种功能。环状RNA(CircRNAs)是一种非编码转录本,在许多生理和病理状态的发生和发展中起着关键作用。

2021-12-16

Nature Communications:研究揭示脊髓室管膜瘤肿瘤微环境和多种细胞的互作网络

 室管膜瘤是发生在儿童和成人中枢神经系统(CNS)的神经上皮恶性肿瘤,常见发生于幕上、颅后窝和脊髓位置。与脑部室管膜瘤多发生于儿童不同,脊髓室管膜瘤多见于成人。手术切除是目前脊髓室管膜瘤的主要治疗方法,但不是所有病人均具备全切除手术条件。对于不接受辅助放化治疗的次切除患者,肿瘤复发率高达50%-70%。因此,发现新型治疗靶点和治疗策略对于临床室管膜

2021-12-02

Cell Research:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

 RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,比如目前全球范围内流行的COVID-19疫情,严重威胁

2021-11-17

保护性耕作土壤微生物群落网络及装配机制研究取得进展

  东北黑土是我国重要的土壤资源,在保障国家粮食安全和生态安全上具有重要地位。然而由于长期不合理的传统农业耕作模式,导致土壤侵蚀、土壤有机质下降、土壤养分和水分库容变小,土壤退化问题严重。近年来,以减少耕作频率及秸秆还田为核心的保护性耕作技术被广泛应用,保护性耕作通过增加外源有机物输入、减少土壤扰动,有效降低了土壤侵蚀强度,促进了土壤有机

2021-11-09

Molecular Psychiatry发表 揭示神经调控手术治疗强迫症的脑网络机制

日前,北京大学心理与认知科学学院、北京大学麦戈文脑科学研究所、北大-清华生命科学联合中心研究员王征实验室在国际学术期刊Molecular Psychiatry上在线发表题为“Common and differential connectivity profiles of deep brain stimulation and capsulotomy in re

2021-11-03

Genes & Devel:科学家识别出了驱动人类胚胎干细胞行为的核心遗传网络

来自布莱根妇女医院等机构的科学家们利用全基因组遗传筛查技术,在hESCs中过表达并失活了数以万计的基因,结果他们发现了一种能同时控制细胞多能性和细胞凋亡准备状态的关键网络,从而就能帮助确保胚胎发育的最佳条件;相关研究结果或能为癌症遗传学研究提供新的见解,并为再生医学研究提供新的方法。

2021-10-31

Nature子刊发现植物在逆境响应过程中存在RNA介导的基因共表达调控网络

  真核生物基因组可转录产生大量RNA。这些RNA包括编码蛋白质的mRNA和众多非编码RNA(ncRNA)。ncRNA大致可分为两大类:看家ncRNA(housekeeping ncRNA)和调控性ncRNA。看家ncRNA包括参与蛋白质合成的核糖体RNA(rRNA)、转运RNA(tRNA),参与RNA剪接的snRNA和参与RNA修饰的s

2021-10-24

科研人员开发基于分子网络特征整合单细胞数据的新方法

  随着单细胞测序技术的快速发展,多个全球性的、大规模的细胞图谱项目相继启动,例如人类细胞图谱计划等。然而,把来自于不同组织、不同发育阶段或者只有很少重叠细胞类型的单细胞转录组数据集进行准确有效的整合仍然具有非常大的挑战性。因为当前整合单细胞数据的方法需要校正批次效应从而达到整合分析的目的,而上述所涉及的数据集的批次信息不清晰,利用这些方

2021-10-17

CRISPR/Cas9组合筛选揭示了人类乳腺癌中相互作用的肿瘤抑制基因和治疗靶点的上位性网络

大多数癌症是由多种基因改变驱动的,但这些改变在肿瘤发生过程中是如何协同作用的仍然是未知数。

2021-10-27