中山大学生命科学学院RNA组学团队开发PolⅢ转录的非编码RNA功能网络信息库
来源：中山大学 2022-01-02 19:53
中山大学生命科学学院RNA组学团队杨建华教授等开发了Pol3Base数据和信息库，系统鉴定RNA聚合酶III（PolⅢ）转录的非编码RNA(P3RNA)，全面解析P3RNA的互作组、表达、进化、表观转录组、疾病变异及调控网络。Pol3Base 网站整合了由不同转录因子调控的数千个 RNA 聚合酶 III 转录的 ncRNAs 转录组数据。Pol3Base 的
中山大学生命科学学院RNA组学团队杨建华教授等开发了Pol3Base数据和信息库，系统鉴定RNA聚合酶III（PolⅢ）转录的非编码RNA(P3RNA)，全面解析P3RNA的互作组、表达、进化、表观转录组、疾病变异及调控网络。
Pol3Base 网站整合了由不同转录因子调控的数千个 RNA 聚合酶 III 转录的 ncRNAs 转录组数据。Pol3Base 的所有结果都存储在MySQL数据库，并通过网页展示。
RNA组学团队率先开发一系列分析流程去发掘～79000个PolⅢ转录的非编码RNA(P3RNA)与转录因子的互作组以及这些P3RNA与240多种RNA结合蛋白之间的相互作用网络；揭示了70个正常组织和28种不同肿瘤类型中P3RNA的表达谱及9700个表观RNA修饰位点。此外，通过比较人类和小鼠，发现了大约4000个进化保守的P3RNA；在32个不同的肿瘤组织中鉴定了上万种 tsRNA。通过分析体细胞突变数据，Pol3Base还提供研究了这些ncRNA的突变图谱，以帮助揭示它们在多种疾病中的潜在作用。
该研究近日在Nucleic Acids Res杂志上在线发表，杨建华教授、屈良鹄教授、李斌副特聘研究员和郑凌伶副教授为论文的共同通讯作者。蔡黎、宣佳佳博士生为共同第一作者。(生物谷Bioon.com）
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