Nat Microbiol | 微生物世界的新视角:microbeMASST质谱工具揭示微生物代谢网络
microbeMASST相比其他质谱搜索工具的最大创新之处在于其独特的数据库架构和搜索算法。
2024-02-11
Dev Cell | 同济大学陈嘉瑜/高绍荣/江赐忠/高睿等揭秘TFAP2C在小鼠着床期间转录因子网络的中心角色
该研究清楚地阐明了以TFAP2C为中心的TF网络对早期胚胎发育的微调调控,该网络连接配子遗传代谢基因、亲本遗传环境和表观基因组,共同调节早期胚胎发育。
2024-04-09
Cell:新方法能够对活细胞内的动态信号网络进行成像观察
活细胞受到多种分子信号的轰击,从而会影响它们的行为。如果能够测量这些信号以及细胞如何通过下游分子信号网络对它们做出反应,就能帮助科学家们更多地了解细胞是如何发挥作用的,包括当细胞衰老或患病时会发生什么
2023-12-27
Nature:新研究深入揭示酵母的蛋白-蛋白相互作用网络
早在 20 世纪 60 年代,Stanley Milgram的开创性实验“六度分隔(Six Degrees of Separation)”就证明了人与人之间惊人的紧密联系。如今
2023-11-28
Science:快速的细菌-噬菌体共同进化促进高度复杂的生态网络的出现
按照查尔斯-达尔文在 19 世纪的构想,进化是一个缓慢而渐进的过程,在这一过程中,物种的适应能力是代代相传的。然而,如今生物学家可以看到进化变化是如何在更快的时间尺度上展开的。
2023-11-24
科研人员开发新方法解析水稻穗型变异的因果基因及其调控网络
总之,该研究揭示了顺式调控变异在水稻驯化或育种过程中的选择印迹及其对穗型性状的影响,并开发了一种方法用于鉴定因果基因及解析基因调控网络
2023-11-27
研究人员开发出基于物理信息的无监督复值网络架构
该团队提出了高效的复值注意力混合器(ECA-Mixer)架构,用于快速准确的物理信息彩色全息重建。该架构由三个核心模块组成——编码器、非线性变换器和解码器。
2023-11-10
Nature:迟洪波团队利用单细胞CRISPR筛选,在体内绘制肿瘤T细胞命运调控网络
这项研究揭示了肿瘤内CTLs分化和功能的多样性及关键的调控转录因子,并为整合CTLs细胞命运基因调控网络和改善肿瘤免疫反应的潜在靶点提供了一个系统框架。
2023-11-17