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Science Advances:揭示基因组“无用”序列稳定染色三维结构细胞稳态机制

  人类基因组中的非编码序列在多种生物学过程中发挥着至关重要的作用,如非编码RNA、启动子、增强子和转座子等。作为在基因组中占比约98%的非编码区域,仍有大量是功能未知的,这些曾被认为是基因组中“垃圾”的区域,已被逐渐证实存在重要功能。基因组的三维结构会影响基因的转录调控或其他细胞生命活动,然而,除了研究较多的增强子-启动子成环所形成的三

2021-11-19

Genome Biology:科研人员开发出在单细胞中识别染色类染色拓扑相关结构域结构的算法

  基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中,这一高级结构即三维基因组学,对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获(3C),尤其是高通量技术(Hi-C,ChIA-PET)的发展推动了三维基因组的研究,发现了包括染色质拓扑相关结构域(TAD),染色质环等一系列层次化的结构特征。近年来,单细胞水平下的Hi-C研究成为三维

2021-08-02

关于相分离通过调控染色三维结构重组促进细胞命运转变的研究在Cell Stem Cell发表

真核细胞染色体通常会有序的折叠,在空间上会形成有序的三维结构。这些三维结构由大到小主要分为区室分隔(compartments)、拓扑相关结构域(Topological-Associated Domains,TADs)以及染色质环状结构(loops)等。细胞命运转变过程中往往伴随着染色体三维结构的剧烈变化,而这些变化对于推动细胞命运转变的进行起到重要作用。TA

2021-06-03

Nat Med:缩短抗原结合结构域的接头可提高CD22 CAR-T细胞的疗效

2021年4月30日讯/生物谷BIOON/---尽管靶向CD19的嵌合抗原受体(CAR)T细胞(CAR-T)能够在B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)患者中诱导病情缓解,但是较大的一部分患者会因CD19丢失发生疾病复发。与CD19一样,CD22在B系细胞中广泛表达,因此可作为B-ALL免疫治疗的替代靶点。在一项新的研究中,来自美国宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学

2021-04-30

Cell:N末端结构域抗原图谱揭示SARS-CoV-2的脆弱位点

2021年3月23日讯/生物谷BIOON/---科学家们了解到,抗击COVID-19感染的抗体识别出了大流行冠状病毒SARS-CoV-2的一个较少研究的区域。这些抗体在以前感染患者的血液样本中被发现,并被发现能有效地防止病毒感染细胞。SARS-CoV-2刺突蛋白是打开细胞大门的钥匙,抗体与刺突蛋白结合来阻断这一功能。人们对研究靶向刺突蛋白的受体结合结构域(R

2021-03-23

细胞可以在细胞质中合成DNA

2021年2月13日讯/生物谷BIOON/---在过去的十年中,有零星的报告称在细胞质中发现了哺乳动物细胞自身的DNA,主要是在疾病和衰老的情况下。虽然在细胞质中发现来自入侵有机体的DNA并不罕见,但是发现来自有机体自身的遗传密码--以从RNA模板合成的互补DNA(cDNA)的形式---却让科学家们感到困惑。在每一种情况下,cDNA都来自于内源性逆转录转座子

2021-02-13

一大类哺乳动物基因在将相邻精子连接在一起的细胞质桥上并不完全共享

2021年1月17日讯/生物谷BIOON/---根据一项对包括小鼠、猕猴和男性在内的生物体精子的新研究,一大类哺乳动物基因在整个精子发育和分化过程中并非完全共享。这一发现解释了为何睾丸中的基因表达模式往往相对于其他所有组织表现出异常。相关研究结果于2021年1月14日在线发表在Science期刊上,论文标题为“Widespread haploid-biase

2021-01-17

研究揭示核纤层蛋白对人源细胞中染色高级结构及染色运动状态的调控

 细胞核内DNA完全展开长达2米,而一般细胞核的直径仅有10—20微米,因此基因组在细胞核内处于高度折叠的状态,同时不断发生运动变化。染色质的三维结构具有有序性和动态变化性,构成细胞核中各种生物学过程的全新调控层次。通过成像和高通量测序技术,研究者发现染色质高级结构分为染色质环(Loop)、拓扑关联域(Topologically associati

2020-11-17

Cell:揭示新冠病毒S蛋白RBD结构域的中和位点和免疫显性位点

2020年9月23日讯/生物谷BIOON/---新型冠状病毒SARS-CoV-2导致2019年冠状病毒病(COVID-19),如今正在全球肆虐。目前人们迫切需要一种有效的预防疫苗来对抗这种病毒。然而,目前还没有针对SARS-CoV-2的人类疫苗,但大约有120种候选疫苗正在研发中。SARS-CoV-2与另外两种密切相关的高致病性病毒SARS-CoV和 MER

2020-09-23

结构域边界插入来调节基因组的空间折叠

 北京时间2020年8月31日晚23时,美国费城儿童医院和宾夕法尼亚大学医学院的Gerd Blobel教授,其实验室的张帝(Di Zhang),和他们的合作者在Nature Genetics上发表了题为Alteration of genome folding via contact domain boundary insertion的论文,报道了通

2020-09-03