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Nature:新研究在单细胞分辨率下绘制出人类肠道的空间图谱

当你想到自己理想中的社区时,也许你会想到绿树成荫的街道,或者一个紧密团结、互相帮助的社区。你很可能不会想到你的消化系统。

2023-07-25

Nat Microbiol:利用完整HCMV病毒颗粒的空间蛋白图谱揭示疱疹病毒HCMV如何欺骗人类宿主细胞

疱疹病毒非常狡猾:一旦感染,就永远无法摆脱它。这是因为疱疹病毒会终生潜伏在人体内的某些宿主细胞中。几乎每个成年人都在不知不觉中携带了九种不同的人类疱疹病毒中的至少一种。由于年龄、压力或免疫系统减弱,疱

2023-08-09

科研人员发表关于单细胞和空间组学技术在肝脏领域应用的综述文章

该文章介绍了多种前沿单细胞组学实验技术和空间组学实验技术并总结了常见的应用场景,剖析了这些新兴技术应用于肝脏样本可能产生的问题及潜在的实验或计算生物学解决方案。

2023-07-20

我国科学家构建出猕猴大脑皮层单细胞空间分布图谱

在一项新的研究中,来自中国多家研究机构的研究人员利用自主研发的空间转录组测序技术Stereo-seq以及snRNA-seq技术,绘制了猕猴大脑皮层细胞类型分类图谱,揭示了细胞类型组成与灵长类动物各个脑

2023-07-19

Cell:世界首套单细胞分辨率的猕猴大脑皮层细胞空间分布图谱发布

该研究产生了较为完整的世界首套猕猴全脑皮层的单细胞以及空间转录组数据,为后续的相关研究提供了重要的数据资源库,现已实现公开共享。 

2023-07-14

Advanced Science:韩敬东团队开发转录组数据空间重构新算法

该研究建立了一种单细胞/寡细胞转录组数据从头空间重构算法——De Novo Coalescent Embedding(D-CE)。该研究利用细胞-细胞转录相关网络的非线性嵌入方法,从头重构了单细胞转录

2023-06-21

空间转录组数据多模态可视化工具研究取得进展

目前已有工具可以将二维切片的基因表达模式进行可视化,或者进一步堆叠多张切片并形成组织的三维静态视图,但在三维空间中对空间转录组数据的分子特征和空间形态进行交互式探索仍然是一个难点。

2023-06-05

江华苦茶初生和次生代谢产物在不同成熟度叶的空间分布研究取得新进展

茶叶所茶叶品质化学与营养健康课题组吴文亮博士后在江华苦茶初生和次生代谢产物在不同成熟度叶的空间分布研究取得了新进展。相关研究成果以《Comprehensive metabolic analyses p

2023-06-07

Nature:揭示黏连蛋白、CTCF和DNA张力在染色体空间组装中的作用

在一项新的研究中,来自荷兰代尔夫特理工大学和奥地利维也纳生物中心的研究人员发现在我们的细胞核中,两种蛋白复合物承担着染色体空间组装的主要责任,而DNA张力在其中起着令人惊讶的作用。

2023-04-26

Nature子刊:李婧翌团队开发用于单细胞多组学和空间组学的数据模拟和统计推断的多功能模拟器scDesign3

总的来说,scDesign3是一个多功能套件,用于基准测试计算方法和解释单细胞和空间组学数据。

2023-05-15