空间转录组数据多模态可视化工具研究取得进展
目前已有工具可以将二维切片的基因表达模式进行可视化,或者进一步堆叠多张切片并形成组织的三维静态视图,但在三维空间中对空间转录组数据的分子特征和空间形态进行交互式探索仍然是一个难点。
江华苦茶初生和次生代谢产物在不同成熟度叶的空间分布研究取得新进展
茶叶所茶叶品质化学与营养健康课题组吴文亮博士后在江华苦茶初生和次生代谢产物在不同成熟度叶的空间分布研究取得了新进展。相关研究成果以《Comprehensive metabolic analyses p
研究发现蜜蜂导航自带“认知地图”
该研究提出跟随蜂能够从“舞蹈语言”中提取方向和距离信息,并能将上述信息与蜂巢周边空间环境的位置信息相互叠加,从而得出食物源的真实位置并指示导航过程。
Nature:揭示黏连蛋白、CTCF和DNA张力在染色体空间组装中的作用
在一项新的研究中,来自荷兰代尔夫特理工大学和奥地利维也纳生物中心的研究人员发现在我们的细胞核中,两种蛋白复合物承担着染色体空间组装的主要责任,而DNA张力在其中起着令人惊讶的作用。
Nature子刊:李婧翌团队开发用于单细胞多组学和空间组学的数据模拟和统计推断的多功能模拟器scDesign3
总的来说,scDesign3是一个多功能套件,用于基准测试计算方法和解释单细胞和空间组学数据。
Nature子刊:戴磊团队开发SEER-FISH成像技术,解析微生物组空间结构
该研究发展了一种可容错编码的序贯荧光原位杂交(SEER-FISH)技术,用于解析复杂微生物群落的空间结构。
Cell:在单细胞分辨率下揭示小鼠大脑衰老的分子和空间特征
在一项新的研究中,来自美国哈佛大学的研究人员的新发现为我们提供了炎症与随着年龄增长而经历的认知障碍之间的关系的新见解,并表明这可能是一种细胞链式反应的结果。相关研究结果近期发表在Cell期刊上。
空间多位点测序为肝癌异质性评估和患者免疫分型提供新思路
近日,上海交通大学医学院附属仁济医院肝脏外科/肝移植中心杭化莲团队和上海市肿瘤研究所王存团队合作在《Genome Medicine》
Cell:新研究构建出结直肠癌的二维和三维空间图谱
如今,在一项新的研究中,来自美国哈佛医学院的一个研究团队将组织学与前沿的单细胞成像技术相结合,构建出大规模的结直肠癌二维和三维空间图谱。
上海交大杭化莲/王存团队通过空间多位点测序,为肝癌异质性评估和患者免疫分型提供新思路
当前大多数用于肝癌预后风险评估的模型都是基于单区域采样队列开发,这些风险评估模型在开发时未完全考虑瘤内异质性这一重要因素,因此很容易受采样偏倚的影响,从而导致其准确性受到较大限制。