Science子刊：发现经常突变的癌蛋白的空间染色体组织的新作用
2019年5月29日讯 /生物谷BIOON /——威斯达研究所的一项新研究揭示了蛋白质ARID1A的功能，该蛋白由一种基因编码，这种基因是人类癌症中最常见的突变之一。根据发表在《Science Advances》上的这项研究，ARID1A在基因组的空间组织中发挥着作用；因此，它的缺失对整体的基因表达具有广泛的影响。这一发现为破译与几种癌症特别是卵巢癌相关的分子变化提供了重要信息。"我的实验室一直在
科学家绘制造血干细胞扩增组织的3D转录组图谱
血液系统中贮藏着一种具有自我更新、分化成各种血细胞潜能的成体干细胞，称为造血干细胞，它能够维持机体长久造血和组织稳态。造血干细胞移植是恶性血癌的有效治疗手段，但干细胞来源不足成为限制该治疗广泛应用的瓶颈。因此，造血干细胞的发育，尤其是造血干细胞扩增的研究备受关注。然而，现在的研究主要集中在特定细胞群体或关键因子的“线性化”或“平面化”解析，缺乏全面“立体化”的分析。从系统生物学角度解析
如何利用DNA编码化合物库的化学空间帮助新药研发
2016年12月9日Robert A. 等研究者发表在《Nature Reviews Drug Discovery》上的一篇标题为《DNA-encoded chemistry： enabling the deeper sampling of chemical space》的论文引起了世界范围新药研发领域的广泛关注。在文中，作者详细阐述了DNA编码化合物库（DEL
DNA测序新技术如何通过肿瘤细胞的详细图谱帮助我们治疗癌症？
2019年5月10日讯 /生物谷BIOON /——一种新的DNA测序技术可以让科学家追踪单个癌细胞的基因错误。这是史上第一次科学家们能够重建肿瘤的生命史，并了解细胞DNA中的一个错误是如何导致肿瘤无法控制的生长的。这项新技术将帮助医生了解特定癌症是如何演变的，并为每位患者量身定制治疗方案，使其更有效、更成功。我们是由数十亿个细胞组成的，它们共同构成我们身体的每一部分。这些细胞中的一个在其遗传密码中
Nat Commun：科学家绘制肺结核小鼠肺部免疫反应图谱
2019年4月30日讯 /生物谷BIOON /——下图显示了小鼠肺部结核病感染的情况，免疫细胞在细菌周围形成肉芽肿。不同的符号代表活跃基因的信使RNA，而肉芽肿中心和周围的细胞相比mRNA的种类和分布是不同的。图片来源：Nature Communications卡罗林斯卡医学院的研究人员Berit Carow、Martin Rottenberg以及他们在SciLifeLab和波士顿大学医学院的同事
科学家成功解读硬粒小麦全基因组图谱
近日，来自意大利、加拿大、德国等多国科研机构的科学家共同在Nature Genetics上发表了题为“Durum wheat genome highlights past domestication signatures and future improvement targets”的文章，绘制并解读了硬粒小麦（durum wheat）的全基因组图谱，这对于比较和挖掘小麦祖先中的优异等位基因具有重
Cell：通过构建胰腺癌干细胞分子依赖性图谱，揭示胰腺癌治疗新策略
2019年4月23日讯/生物谷BIOON/---耐药性和癌症复发仍然是胰腺癌治疗所面临的关键挑战。在一项新的研究中，来自美国加州大学圣地亚哥分校等研究机构的研究人员通过使用RNA测序（RNA-seq）、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）和全基因组CRISPR分析来绘制胰腺癌干细胞的分子依赖性图谱，其中胰腺癌干细胞是优先驱动肿瘤发生和进展的高度治疗抵抗性细胞。相关研究结果发表在2019年4月18
Cell：利用uliCUT&RUN方法在单细胞和单个胚胎中构建染色质上的蛋白结合图谱
2019年4月24日讯/生物谷BIOON/---在一项新的突破性研究中，来自美国匹兹堡大学和马萨诸塞大学医学院的研究人员对一种称为CUT&RUN（cleavage under targets and release using nuclease）的方法进行改进，使得在使用少量细胞（包括单细胞和单个植入前胚胎）的情形下，它适合用来研究转录因子和其他的DNA结合蛋白在染色质上的占据情况。相关研
Science：新的ALS基因表达图谱为疾病进展提供了前所未有的细节
2019年4月15日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国纽约基因组中心、布罗德研究所、哥伦比亚大学、斯坦福大学、纽约大学、弗莱提荣研究所（Flatiron Institute）和瑞典皇家理工学院的研究人员利用新技术绘制出脊髓样本的基因表达图谱，这就为肌肉侧索硬化症（ALS，也称渐冻人症）患者的疾病发生和进展机制提供了新的见解。他们将空间转录组学（spatial transcrip
Science：利用一种新的工具来绘制丰富的细胞和组织功能图谱
2019年4月11日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国布罗德研究所的研究人员开发出的一种新的技术让人们对组织中的细胞组成（cellular organization）有了前所未有的了解。这种称为Slide-seq的方法利用基因测序来绘制详细的三维组织图谱，不仅揭示出组织中存在哪些细胞类型，而且还揭示出它们所处的位置和它们正在做什么。Slide-seq方法是在布罗德研究所研究员E