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刘陈立/傅雄飞开发空间连续定向进化系统,实现合成生物元件的大规模平行进化

着眼于合成生物学研究中可用元件匮乏这一亟待解决的关键问题,在现有连续定向进化方法的基础上,通过实验与模型模拟相结合的方式定量研究了宿主细菌的空间迁移运动对其噬菌体进化的作用规律

2022-09-23

Cell:破迷长达50年的谜团,新研究揭示了细菌是如何移动

在一项新的研究中,来自美国弗吉尼亚大学医学院的研究人员和他们的合作者解决了一个数十年来关于大肠杆菌和其他细菌如何能够移动的谜团。相关研究结果发表在2022年9月15日的Cell期刊上。

2022-09-28

Nature Communications:发现环形RNA中存在驱动翻译的短序列元件

该研究通过对随机序列的筛选,系统性鉴定出多个类IRES(内部核糖体进入位点)元件来驱动环形RNA的翻译,并进一步通过分析质谱数据,鉴定出近千个能翻译的内源性环形RNA

2022-07-06

Nucleic Acids Research:报道非编码调控元件能够稳定染色质三维结构

发现了一系列位点与细胞生长和存活密切相关。该研究首次发现该类增强子位点的删除能够改变大范围染色质结构,通过同时影响多个非必需基因表达所产生的协同效应来影响细胞稳态。

2022-04-26

Cell:合成基因元件的跨物种表达有助发现人类微生物组衍生性的代谢物

超过60%的药物,包括抗生素和癌症治疗药物,都来自于由代谢基因编码的小分子形式的天然产物。这些分子通常形成复杂的化学结构,而且是在包括细菌、植物和人类在内的多种生命形式中经过数十亿年的进化而形成的。然

2022-04-09

"女娲"基因组计划第2篇:徐涛/何顺民团队发布中国人群可移动元件插入变异图谱

  可移动元件(也被称为转座子或转座元件)约占人类基因组的一半。在人类基因组中,Alu、LINE-1(L1)、SINE-VNTR-Alu(SVA)以及HERV-K等是普遍认为仍然活跃的可移动元件家族,它们能够通过转座作用在基因组上形成新的插入,这种现象被称为可移动元件插入(Mobile Element Insertion,MEI)。转座事

2022-03-03

Nature Genetics:科学家揭示人类基因调控元件的序列决定因素

  DNA可以决定基因表达的位置和时间,但控制基因表达的全套序列决定因素仍不清楚。近日,芬兰赫尔辛基大学的研究团队在《Nature Genetics》发表了题为“Sequence determinants of human gene regulatory elements”的文章。研究人员使用大规模平行报告试验测量了比人类基因组大100倍

2022-03-17

Nature Genetics:科学家发现DNA复制叉移动速度是细胞命运变化的基础

细胞的全能性在早期胚胎发育中出现,但其分子基础的特征仍不明显。德国慕尼黑大学的研究团队发现,DNA复制叉移动速度是细胞命运变化的基础,并促进细胞重编程。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》上,题为:DNA replication fork speed underlies cell fate changes and promotes rep

2022-03-20

以circRNA和外泌体调节元件为靶点的反义寡核苷酸将成为一种新的抗肿瘤策略

环状RNA(CircRNAs)由一大类无5‘末端帽和3’末端聚(A)尾的非编码RNA组成,它们由RNA聚合酶II通过反向剪接转录而形成共价闭合的RNA环。随着下一代测序技术的发展,特别是无rRNA测序技术的应用,在真核生物中发现了大量的CircRNA。

2022-02-25

葫芦科嫁接发根体系用于鉴定砧穗互作可移动信号研究中取得新进展

近日,华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室、园艺林学学院别之龙教授课题组在葫芦科作物发根体系和砧穗互作方面的研究成果以“An efficient root transformation system for CRISPR/Cas9-based analyses of shoot–root communication in cucurbit crops”

2022-02-03