Genome Biology:新技术90分钟完成全基因组序列分析
美国国家儿童医院(Nationwide Children's Hospital)的研发人员最近在Genome Biology上发布了一个自主开发的分析软件,表示这个软件使寻找全基因组致病变异从几周缩短到按几十个小时
PNAS:血液中的基因表达可区别病毒和细菌导致的发热
一项研究报告说,血液中的基因表达特征可以帮助区别幼儿的发热是由病毒还是由细菌造成的。发热是病毒和细菌感染的一个常见症状,但是发热源常常在临床检查中不那么显而易见。Gregory Storch及其同事研究了发热儿童的血液是否表现出了病毒和细菌的特定基因表达特征,这些特征可能在区别这两种发热源方面有用。
Nat Commun:“中华全蝎”基因组序列帮助了解节肢动物演化
本期Nature Communications报告了“中华全蝎”(东亚地区一种常见蝎子)的基因组序列草稿。该基因组突显了这种蝎子与其猎物相关的遗传特征,包括夜行行为、进食特征以及去毒功能等等,为研究节肢动物的适应性和演化提供了一个宝贵资源。 蝎子以“活化石”著称,代表着一个独特类型的节肢动物,因为它们保持了其古代节肢动物祖先的原始解剖特征。因此,它们为研究这类动物的演化提供了一个关键模型。
PNAS:世界最大病毒有一千多基因
北京时间10月16日消息,在智利海域,科学家发现了世界上个头最大的病毒,拥有1000多个基因。这一发现让科学家陷入惊讶之中。这种病毒被称之为“Megavirus chilensis”,基因组含有近126万个碱基对,是最为复杂的DNA病毒,个头比此前的纪录保持者――2003年分离出的拟菌病毒大6.5%。 这种巨型病毒是在智利拉斯克鲁塞斯一个研究站附近提取的海水样本中发现的。
Science:病毒神秘基因可使毛虫变自杀僵尸
据国外媒体报道,日前,最新一项研究显示,一种携带特殊基因的细菌可对毛毛虫“洗脑”,让它们自杀液化溶解。 一种携带特殊基因的病毒可对毛毛虫“洗脑”,让它们自杀液化溶解 这种病毒可迫使“僵尸”毛毛虫爬至树梢,心甘情愿地自杀使身体溶解成粘性物质。
Cell Host & Microbe:追踪HIV相关病毒和灵长类动物基因组在进化上的军备竞赛
美国弗雷德-哈钦森癌症研究中心科学家Michael Emerman博士和Harmit Malik博士领导的一个研究小组结合进化生物学和病毒学方法追踪一些HIV相关病毒进化出战胜灵长类动物中新发现的细胞防御系统的能力。2012年1月26日,研究结果在线发表在Cell Host & Microbe期刊上。
Science:从宏基因组数据中分离出单个物种基因组序列
从由细菌、古细菌和病毒组装的错综复杂宏基因组DNA序列中,研究人员获得一种神秘的广古菌的整个基因组序列。图片来自Vaughn Iverson/华盛顿大学。 宏基因组学(metagenomics,译者注:也常译作环境基因组学)就是取样---一勺泥土或一杯海水---然后对样品内所有DNA进行测序。