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Nature Communications:研究发表单细胞转录组数据检索新方法和参考数据库

 作为细胞异质性研究的重要工具,单细胞转录组测序技术近年来蓬勃发展,并积累了大量研究数据。若能有效利用现有的单细胞数据进行检索与推断,研究者便能更好地进行新测序单细胞的注释,以及综合多数据集的研究。然而,精确的单细胞转录组数据检索和注释需要克服两个挑战:一、数据集之间的批次效应(batch effect)会显着影响细胞检索的可靠性;二、目前缺少跨物

2020-07-15

新冠病毒可能令健康人患糖尿病,科学家建糖尿病监测数据库

越来越多的学术研究和新冠患者的临床证据表明,新冠病毒病毒会破坏人体产生胰岛素的细胞,从而令健康人患上糖尿病。为此,科学家已经开始行动起来,建立数据库,收集没有糖尿病病史或血糖控制问题的COVID-19和高血糖患者的信息。对于大多数1型糖尿病患者来说,身体的免疫细胞开始破坏胰腺中的细胞,也就是负责产生激素胰岛素的细胞,这个过程通常是突然的。糖尿病已经被认为是导

2020-06-27

新一代二维码储存管“助力”生物样本

新一代二维码储存管“助力”生物样本库人类迈入了生物医药行业大数据时代,相关产业均离不开高质量临床样本的支撑,使得生物样本需求量大大增加,生物样本库的建立和发展不可或缺。生物样本库(Biobank)即收集、存储生物样本以及与其相关资料的资源库。生物样本包括细胞、组织、体液、血清、血浆、全血以及经处理的某些生物大分子(核酸、蛋白质等)。生物样本库的类型 

2020-06-28

《自然》发布迄今最大规模人类遗传变异体数据库

 今日,顶尖学术期刊《自然》的最新一期如约上线,登上封面的主题是“基因组聚集数据库(gnomAD)”。这份由多国研究者联合发展起来的公开目录,是迄今为止最大规模的人体遗传变异体数据库,汇集了超过14万人的基因组测序或外显子组测序数据。在本期《自然》杂志上,一共发表了4篇相关论文。此外,在Nature Medicine、Nature Communic

2020-05-29

科学家开发出新型遗传数据库—gnomAD 有望帮助攻克多种罕见疾病!

2020年5月31日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,来自麻省理工学院、哈佛大学和伦敦帝国理工学院等机构的科学家们通过研究开发了世界上最大的DNA遗传突变公开数据库,其中有些突变会引发人类疾病。研究人员在7篇具有里程碑意义的文章中描述了这种数据库,即基因组聚合数据库(gnomAD,Genome Aggregation Database), 其中包括了来自

2020-05-31

精神分裂症遗传数据库升级更新

 精神分裂症是一种复杂且具有较高异质性的疾病,其遗传率高达0.8,终身患病率约为1%。精神分裂症的确切致病基因如何鉴定是目前遗传学研究的一个重要挑战。近些年来,随着基因分型技术的发展,多个与精神分裂症相关的遗传风险位点已经被鉴定。例如,基于全基因组关联研究(GWAS)的方法,研究者发现人类基因组上超过200个精神分裂症风险基因座;基于拷贝数变异(C

2020-05-16

博雅打造临床级生物样本整体解决方案 助力精准医学高质量发展

点击观看博雅生物样本库视频:随着精准医学时代的开启,生物样本库的建设逐渐受到了各国的重视。生物样本库为细胞及基因治疗等个性化疗法的开发提供了丰富的生物样本和数据,推动着心血管疾病、血液病、免疫系统疾病、糖尿病以及恶性肿瘤等重大疾病的治疗进展。作为一家在生命健康领域具有广泛影响力的跨国产业集团,博雅控股集团创建了集细胞自动化技术、细胞制造、细胞存储和细胞治疗为

2020-05-28

预防艰难梭菌感染 微生物组疗法RBX26603期临床数据积极

 今日,Ferring Pharmaceuticals和旗下Rebiotix公司联合宣布,其微生物组疗法RBX2660,在预防艰难梭菌感染(CDI)的关键性3期试验中取得积极的初步结果。新闻稿指出,这一临床开发计划是全球首个获得3期临床试验积极数据的微生物组研究。艰难梭菌是一种导致腹泻和结肠炎的细菌。据估计,每年仅在美国就会导致多达50万人患病,并

2020-05-07

国家生物信息中心2019新型冠状病毒信息持续更新共享

国家生物信息中心(CNCB)/国家基因组科学数据中心(NGDC)首批自主收录的5株2019新型冠状病毒基因组序列实现与美国NCBI核酸数据库GenBank数据同步与共享。CNCB/NGDC建立的2019新型冠状病毒信息库(2019nCoVR)上线运行以来,已汇交并整合全球范围内产出的82株病毒的87条非冗余基因组序列信息,是目前收录2019新型冠状病毒基因组

2020-02-07

研究建成小鼠肠道微生物资源

 1月7日,《自然-通讯》发表了中国科学家完成的小鼠肠道微生物资源库工作。肠道微生物是近年来生命科学和健康领域研究的前沿和热点。越来越多的证据表明,肠道微生物与宿主健康和生长发育密切相关,在未来人体健康管理和医疗产业发展中,具有十分重要的作用。肠道微生物资源库的建设,是开发利用肠道微生物的基础,是认知宿主—微生物互作机制和开发微生物药物的关键。此次

2020-01-09