Genome Biology：科研人员开发出在单细胞中识别染色质类染色质拓扑相关结构域结构的算法
基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中，这一高级结构即三维基因组学，对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获（3C），尤其是高通量技术（Hi-C，ChIA-PET）的发展推动了三维基因组的研究，发现了包括染色质拓扑相关结构域（TAD），染色质环等一系列层次化的结构特征。近年来，单细胞水平下的Hi-C研究成为三维
Nat Commun：表观遗传学代码重塑的染色质状态或能赋予小鼠肝脏一定的再生潜能
2021年7月10日 讯 /生物谷BIOON/ --研究人员推测，对肝脏再生至关重要的基因表达的高度控制模式是由静止的肝脏细胞中的表观遗传学代码所编码的；近日，一篇发表在国际杂志Nature Communications上题为“Chromatin states shaped by an epigenetic code confer regenerative
Cell Reports:组蛋白变体的染色质组装研究取得进展
Cell Reports在线发表了中国科学院生物物理研究所研究员周政课题组与中科院物理研究所副研究员李伟课题组合作完成的研究论文Recognition of the inherently unstable H2A nucleosome by Swc2 is a major determinant for unidirect
关于相分离通过调控染色质三维结构重组促进细胞命运转变的研究在Cell Stem Cell发表
真核细胞染色体通常会有序的折叠，在空间上会形成有序的三维结构。这些三维结构由大到小主要分为区室分隔（compartments）、拓扑相关结构域（Topological-Associated Domains，TADs）以及染色质环状结构（loops）等。细胞命运转变过程中往往伴随着染色体三维结构的剧烈变化，而这些变化对于推动细胞命运转变的进行起到重要作用。TA
间充质干细胞分泌细胞外小泡可促进小鼠局灶性脑缺血后脑血管生成、脑重塑和神经功能恢复
来源于右侧细胞类型的间充质基质细胞(MSC)来源的小细胞外小泡(SEV)可促进中风的康复。在这一过程中，微血管重塑起着核心作用。因此，作者研究了MSCsEVs对体外培养的人脑微血管内皮细胞(hCMEC/D3)增殖、迁移和管状形成的影响，以及对小鼠大脑中动脉闭塞(MCAO)后缺血后血管生成、脑重塑和神经功能恢复的影响。在体外，从低氧(1%O2)而不是“常氧”(
研究揭示人类衰老细胞空间基因组表观调控核心机制并绘制衰老相关染色质全局景观图谱
中国科学院上海营养与健康研究所研究员孙宇课题组经合作研究在Nature Aging上，在线发表题为KDM4 Orchestrates Epigenomic Remodeling of Senescent Cells and Potentiates the Senescence-Associated Secretory Ph
研究从染色质三维结构水平揭示籼粳稻耐热性差异机制
近日，中国农业科学院生物技术研究所作物耐逆性调控与改良创新团队从染色质三维结构上揭示了籼稻和粳稻的高温抗性差异机制，为研究表观遗传调控作物重要农艺性状及提高抗逆性提供了新的研究视角。相关研究成果发表在国际学术期刊《BMC Biology》（BMC生物学）上。据专家介绍，染色质三维结构与基因组功能高度相关。目前少数真核生物中仅报道了环境
Immunity：单细胞染色质可读性图谱分析揭示调节性T细胞参与组织修复的分子机制
众所周知，组织中的调节性T细胞（Treg）对于促进组织稳态和再生具有重要作用。在最近一项研究中，来自德国雷根斯堡大学再生医学中心的Markus Feuerer及其团队揭示了健康组织中具有上述功能的Treg细胞的特征。通过研究鼠和人来源的组织特异性Treg细胞的单细胞染色质可阅读性（accessibility），从而定义了一个保守的，不依赖微生物群的组织修复性
研究发现BAF扰动改变染色质可及性
奥地利科学院CeMM分子医学研究中心Stefan Kubicek和Sandra Schick研究组合作取得最新进展。他们表明急性编码BRG1 / BRM相关因子（BAF）扰动会导致染色质可及性即可变化。近日出版的《自然-遗传学》杂志发表了这一最新研究成果。他们使用dTAG系统诱导BAF亚基的急性降解，并证明染色质改变的建立速度快于一个细胞周期的持续时间。使用
Nat Commun：在异染色质中，TALEN的编辑效率是CRISPR-Cas9的5倍
2021年2月4日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国伊利诺伊大学香槟分校的研究人员利用单分子成像技术对基因组编辑工具CRISPR-Cas9和TALEN进行了比较。他们的实验显示，在基因组中紧密压缩的称为异染色质（heterochromatin）的部分，TALEN的编辑效率是CRISPR-Cas9的5倍。脆弱X综合征、镰状细胞贫血、β-地中