Nature Genetics | BANKSY:革命性算法,重塑空间组学数据分析
随着生物技术的快速发展,空间组学数据的产出呈现爆炸式增长,传统的数据分析方法已难以满足研究的需求。BANKSY算法的开发旨在解决这一问题。
2024-03-05
单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。
2024-02-21
Nature子刊:诸颖团队开发空间转录组语义注释新算法Pianno
在这项研究中,研究团队展示了Pianno在注释各种形状的解剖结构以及病灶和细胞类型方面的卓越性能,这些数据来自不同的空间技术平台。
2024-04-10
Nature Communications: 非小细胞肺癌的单细胞和空间转录组学分析
本研究综合数据集可以识别肺肿瘤微环境中巨噬细胞(Mɸ)群体的多种分子变化,这将有助于为制定治疗非小细胞肺癌的策略铺平道路。
2024-06-20
基因组数据揭示淋巴瘤的致命演变
哥伦比亚大学和香港科技大学的研究人员进行的一项研究正在帮助阐明低度淋巴瘤在发展为更具侵袭性的肿瘤时经历了怎样的变化,这可能会启发新疗法的开发。近期,研究结果发表在《自然遗传学》杂志上。
2023-12-21
Nature子刊:浙江大学孙会增/王永成团队开发微生物组单细胞转录组学技术,揭示奶牛瘤胃微生物活性功能类群
该研究利用MscT技术,通过基于BGMGM的泛基因组功能基因比对策略,揭示了瘤胃微生物生态系统原位活性代谢功能类群。
2024-06-16
研究人员发布耐脱水植物基因组数据库
通常情况下极端脱水对植物是致命的,但少数陆地植物在特殊的环境中演化出营养体耐脱水(Vegetative Desiccation Tolerance,VDT)的特性。
2023-12-25
研究揭示ZNF143架构三维基因组的机制
该研究全面解析了ZNF143在染色质三维结构和基因转录调控中的作用,为其它转录因子或反式调控因子在三维基因组架构中的研究提供新的方法和思路。
2024-02-06