基因组数据揭示淋巴瘤的致命演变

哥伦比亚大学和香港科技大学的研究人员进行的一项研究正在帮助阐明低度淋巴瘤在发展为更具侵袭性的肿瘤时经历了怎样的变化，这可能会启发新疗法的开发。近期，研究结果发表在《自然遗传学》杂志上。

尽管通常无法治愈，但许多低度B细胞淋巴瘤发展缓慢且不会危及生命。然而，在一些患者中，肿瘤会转变为更具侵袭性的淋巴瘤并构成更大的威胁。

人们认为，一种名为AID的蛋白质会导致淋巴瘤向更具侵袭性的方向改变，该蛋白质会在整个B细胞基因组中产生突变，但其中许多突变的特征和后果仍然是未知的。

为了更好地了解AID如何改变基因组并转化淋巴瘤，由哥伦比亚研究人员Rebecca Leeman-Neill、Uttiya Basu领导的团队与香港科技大学Dong Song和Jiguang Wang领导的团队开展了合作，共同研究了来自滤泡性淋巴瘤转化为更具侵袭性的类型（称为双重打击淋巴瘤）的患者的肿瘤样本集合。

利用患者疾病进展过程中不同时间收集的样本，研究小组能够对每个肿瘤进行全基因组测序，以追踪转化过程中产生的突变。

基因组数据显示，转化突变集中在许多基因的非编码、超级增强子嵌入的启动子区域，并以意想不到的方式改变了淋巴瘤中的基因表达。

“我们预计这些区域的突变会影响通常由突变启动子控制的基因的转录，但我们也发现增强子-启动子相互作用被重新连接，影响了其他邻近基因的表达，”Leeman-Neill说。

研究人员调查了PAX5启动子中一种特别常见的转化相关突变的后果，该突变导致增强子-启动子相互作用重新连接，从而启动ZCCHC7基因。这些变化改变了核糖体生物合成，导致淋巴瘤细胞中蛋白质合成发生广泛变化，包括DNA修复蛋白、肿瘤抑制因子和当前可用疗法靶向的蛋白质合成下降。

研究结果还表明，增强子重定位在淋巴瘤进展过程中广泛存在。Leeman-Neill说：“这些变化揭示了治疗侵袭性淋巴瘤，甚至预防其发展的潜在机会。”