法国科研团队致力于预测气候变化对浮游生物群落的影响
浮游生物泛指生活于水中而缺乏有效移动能力的漂流生物,其中分有浮游植物及浮游动物。部分浮游生物具游动能力,但其游动速度往往比它自身所在的洋流流速来得缓慢,因而不能有效地在水中灵活游动。来自索邦大学、法国国家科研中心和国家自然历史博物馆的研究团队,通过宏基因组测序与机器学习(machine learning)相结合的方式,分析Tara O
Cancer Biol Med:揭示缺氧影响胰腺癌空间基因表达模式变化的分子机理
2021年8月18日 讯 /生物谷BIOON/ --癌细胞会进化出多种机制来支持其不受控制地生长,以固体组织肿瘤为例,肿瘤微环境对于决定癌细胞的命运至关重要,其是由肿瘤周围的细胞外组分和环境组分所组成;缺氧,或氧气供应水平减少,是多种实体瘤最常见的共同特征,其往往与癌症侵袭力增加、进展和药物耐受性密切相关,这或许使得癌症的治疗极具挑战性。胰腺导管腺癌(PDA
Nat Cancer:新型肿瘤细胞追踪系统ClonMapper或能帮助理解癌细胞的进展及对疗法的耐受性变化
2021年8月17日 讯 /生物谷BIOON/ --谱系追踪方法能使分析复杂种群中的克隆动态成为可能,但通常缺乏将基因组、表观基因组和转录组学测量与感兴趣的特定克隆的活细胞操作进行整合的能力;尽管目前科学家们在医学研究上取得了巨大的进步,但由于肿瘤是由异质性细胞所组成,因此治疗肿瘤仍有挑战性;换句话说,就好像人类家庭一样,肿瘤的单个细胞共享有一些工头的特性和
Genome Biology:科研人员开发出在单细胞中识别染色质类染色质拓扑相关结构域结构的算法
基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中,这一高级结构即三维基因组学,对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获(3C),尤其是高通量技术(Hi-C,ChIA-PET)的发展推动了三维基因组的研究,发现了包括染色质拓扑相关结构域(TAD),染色质环等一系列层次化的结构特征。近年来,单细胞水平下的Hi-C研究成为三维
Cell:身体抗击食物中毒的能力竟存在昼夜节律变化
2021年7月31日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国德克萨斯大学西南医学中心的研究人员发现身体通过产生一种天然抗菌化合物来防止食物中毒的能力在白天增强,因为白天最可能暴露在有毒细菌。这一发现最终可能导致人们开发出最大限度地提高这种免疫反应的定时疗法和疫苗接种方案。相关研究结果于2021年7月28日在线发表在Cell期刊上,论文标题为“T
Science:抗生素抗性元件的时间变化控制着噬菌体与病原体的冲突
2021年7月30日讯/生物谷BIOON/---在自然界中,细菌要与丰富多样的病毒(噬菌体)作斗争,因此需要有广泛的防御系统。抗噬菌体系统与移动基因组(mobilome,基因组中所有可移动遗传因子的总和)中的基因簇集在一起,这表明噬菌体捕食可以通过可移动遗传因子(mobile genetic element, MGE)的流动来推动细菌的进化。尽管不断发现新的
:极性响应的比例型荧光探针用于铁死亡中脂滴和细胞核变化的监测
细胞铁死亡是一种与人类疾病息息相关的细胞死亡方式,目前发现的与细胞铁死亡相关的疾病就包括了癌症,神经性疾病,器官衰竭、免疫系统疾病等。铁死亡是由铁离子依赖的脂质过氧化物过度累积而导致的一种细胞死亡方式,在细胞形态、生物学特征和机制调控中具有独特特征并明显区别于细胞凋亡。脂质代谢在铁死亡发生过程中发挥着重要作用,ROS相关的脂质过氧化积累会影响脂滴等亚细胞器的
气候变化影响下造礁石珊瑚早期共生关系的可塑性研究获进展
中国科学院南海海洋研究所研究员黄晖团队在造礁石珊瑚早期共生关系可塑性研究中取得进展,揭示了升温和酸化影响下造礁石珊瑚幼体早期共生建立以及珊瑚对虫黄藻选择性。相关研究成果相继发表在Frontiers in Microbiology(《微生物学前沿》)和Coral Reefs(《珊瑚礁》)上。造礁石珊瑚和虫黄藻之间的互利共生关系是珊瑚礁生
Frontiers in Microbiology:研究揭示中黑盲蝽不同发育时期肠道微生物的动态变化
近日,中国农业科学院棉花研究所棉花虫害与生物安全创新团队通过分析中黑盲蝽不同发育时期肠道微生物的多样性和组成,探索了中黑盲蝽与其体内微生物的协同进化关系,发现中黑盲蝽肠道微生物的多样性在不同发育阶段呈显着动态变化,为开发新的害虫生物防治策略提供了重要理论基础。相关研究成果发表在《微生物学前沿(Frontiers in Microbio
Science:利用RNA-SPLIT技术揭示Xist RNA的动态变化
2021年6月24日讯/生物谷BIOON/---哺乳动物中的X染色体失活(XCI)使得XX雌性相对于XY雄性的X连锁基因表达水平相等。XCI过程由非编码RNA Xist(X 染色体失活特异性转录物)控制,它在需要失活的X染色体中表达,在那里顺式积累并招募基于染色质的基因沉默所需的因子。顺式限制在单个染色体区域的分子基础尚不清楚,但人们认为这涉及特定的Xist