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Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因与空间演化

CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。

2024-11-23

Cell:科学家识别出与致癌基因改变发生相关的分子通路

本文研究结果揭示了中心DNA修复机制的病理性激活如何通过染色体破碎矛盾地诱发癌症基因组进化。

2024-09-15

Nature Genetics:赵方庆团队开发高通量三维空间转录新技术

MAGIC-seq提出了“拼接芯片”的概念,即通过调整网格间距和多轮编码的方式将多个捕获网格拼接在一起,突破了传统微流控方法的通道限制,实现了高分辨率与大视野的兼顾。

2024-09-13

Nature Communications: 非小细胞肺癌的单细胞和空间转录学分析

本研究综合数据集可以识别肺肿瘤微环境中巨噬细胞(Mɸ)群体的多种分子变化,这将有助于为制定治疗非小细胞肺癌的策略铺平道路。

2024-06-20

​Nature子刊:浙江大学孙会增/王永成团队开发微生物单细胞转录学技术,揭示奶牛瘤胃微生物活性功能类群

该研究利用MscT技术,通过基于BGMGM的泛基因组功能基因比对策略,揭示了瘤胃微生物生态系统原位活性代谢功能类群。

2024-06-16

Nature | 大规模结直肠癌基因研究:寻找预后突变与治疗靶点

这项研究实现了迄今为止最大规模的结直肠癌基因组和转录组的综合分析,并将分子层面的发现与高质量的临床数据相结合,从而识别关键预后因子,这使这项研究有别于其他绝大多数癌症基因组学的研究。

2024-08-09

BBI:化疗或会扰乱乳腺癌患者机体的肠道微生物功能

研究结果表明:1)化疗会诱导机体微生物组的破坏和炎症;2)由此所产生的微生物组干扰与认知功能下降和炎症发生有关;3)那些认知功能受损的患者拥有独特的化疗诱导微生物组的改变。

2024-07-06

Nat Microbiol:帕金森疾病药物或会在缺乏铁离子状况下促使肠道微生物功能恶化

本文研究揭示了两种尚未被研究的药物对机体整体微生物组的影响效应,并识别出了金属离子的隔离或许能作为药物诱导的微生物组紊乱的一种特殊机制。

2024-12-18

Nature:张龙课题报道乳酸感知蛋白和乳酸化转移酶AARS1/2

研究不仅揭示了AARS1/2作为乳酸感知蛋白和乳酸化修饰泛酶的的重要角色,还阐明了乳酸堆积致疾病重症的机理。

2024-10-01

研究揭示海洋巨型单细胞多核钙化藻基因异源多倍化与生物钙化机制

针对仙掌藻和脆叉节藻的钙化模式的差异,该研究揭示了仙掌藻胞外钙化和脆叉节藻次级细胞壁钙化的遗传调控特征。

2024-10-04