Mol Cell:HOXDeRNA 通过与基因组广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子
HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域,从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制,最终激活多个癌症驱动基因,驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。
2024-11-07
Nat Cell Biol:赵方庆团队开发基于编程控制的转录组实时测序新技术
该研究首次提出了转录组智能测序的概念,依托人工智能纳米孔自适应测序算法,能够实时判断测序分子来源,并可编程选择目标测序分子进行全长测序。
2024-11-03
韩欣欣/蔡春晖/邓玮等开发类器官新技术,从单细胞悬浮液培养出大小一致的卵巢癌类器官
该研究为开发量身定制的治疗策略开辟了一条有前景的道路,特别是在肿瘤研究领域,针对卵巢癌治疗的细微差别量身定制治疗策略。
2024-08-16
Cell子刊:韩敬东团队开发机器学习程序,在单细胞水平识别衰老细胞
该研究开发了一种机器学习程序——SenCID(Senescent Cell Identification),它可以准确地识别bulk转录组和单细胞转录组数据中的衰老细胞。
2024-04-17
Nature子刊:张翼/王行环团队开发精确测定单细胞年龄的时钟算法
该研究在ClockDML上发现了与有丝分裂相关的,细胞年龄依赖的染色体可及性,是一种良好的细胞年龄标记物,开发了用该标记物来追踪单细胞年龄的计算方法EpiTrace。
2024-05-13
Nature:重庆大学印明柱团队绘制迄今最大规模泛癌种脉管系统单细胞图谱,揭示肿瘤血管生成的复杂过程
这项研究描绘了肿瘤血管系统的复杂性,为充分理解肿瘤血管生成的复杂过程提供了全景视角,对抗血管生成治疗具有潜在临床意义。
2024-07-15
PNAS丨厦门大学曹彬团队合作发现决定人类及小鼠胎盘滋养层细胞合体化的全新转录因子
该研究首次揭示转录因子TFEB在人类及小鼠胎盘滋养层细胞合体化过程中的保守性调控作用,阐明了mTORC1-TFEB-ERVFRD-1作用轴介导滋养层细胞融合的全新分子调控路径。
2024-07-16
Nature Methods | GPT-4在单细胞分析中的突破:高效的细胞类型识别
该研究不仅证实了GPT-4在生物医学领域的应用潜力,同时也为单细胞RNA测序分析中的细胞类型标注提供了一种新的、高效的解决方案。
2024-04-06
Nature Genetics:赵方庆团队开发高通量三维空间转录组新技术
MAGIC-seq提出了“拼接芯片”的概念,即通过调整网格间距和多轮编码的方式将多个捕获网格拼接在一起,突破了传统微流控方法的通道限制,实现了高分辨率与大视野的兼顾。
2024-09-13