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​Small:北航常凌乾团队开发的高通量、单细胞精度的活细胞力学检测生物芯片及应用

  活体微环境中细胞不断受到诸如拉力、静水压力和剪切力等物理力的作用。细胞对于外界信号的感知和响应是细胞的自我调节以适应和应答外界环境机械力的变化的一种重要机械特性。例如,在肿瘤微环境中,空间结构、张力强度、弹性系数等发生变化时,癌细胞会做出相应的调节以改变自身的机械特性,一方面通过驱动并调整细胞形状、骨架结构以及粘附亲和度,产生特定适应

2022-02-08

Molecular Cancer: 单细胞RNA-seq分析发现一种非编码RNA介导肝癌对索拉非尼治疗的耐药性

索拉非尼是一种多激酶抑制剂,是fda批准的一线药物,用于治疗不能切除的肝细胞癌(Hcc)。不幸的是,这些患者的治疗效果微乎其微,总体生存期仅提高了3个月。在初步应答后,大多数肝癌患者出现抗药性和疾病进展。

2022-01-22

《科学》:泛癌症T细胞单细胞图谱 相关成果发表

  北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)张泽民课题组联合北京大学肿瘤医院季加孚、步召德课题组以及北京大学第三医院,在国际期刊Science上发表了题为“Pan-Cancer Single Cell Landscape of Tumor-Infiltrating T Cells

2021-12-24

Science:我国科学家成功构建肿瘤浸润T细胞的泛癌单细胞图谱

在一项新的研究中,为了建立一种高分辨率的泛癌T细胞图谱,来自中国北京大学的研究人员对各种癌症类型的患者的肿瘤、癌旁组织和血液样本进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq),并收集了其他已发表的scRNA-seq数据集。在校正了混杂因素和批次效应后,对这些不同的数据进行了整合。

2021-12-24

Cell:科学家绘制人类单细胞染色质可及性图谱

   在人类细胞中,总长约2米的基因组DNA通过与组蛋白缠绕形成核小体,并经过螺旋折叠等方式盘绕形成染色体进而团聚于直径10微米的细胞核中。在细胞内的DNA需要进行转录等活动的时候,DNA才会从组蛋白中释放出来,裸露出需要与转录因子结合的位点从而便于转录,染色质的这种特性叫做染色质可及性,暴露的区域被称为“开放染色质”。作为转录

2021-12-10

直播来袭 | 单细胞功能蛋白质组学在肿瘤研究及治疗中的应用

IsoPlexis致力于提供业内广受赞誉的精准单细胞分析系统,助力加速对抗癌症及各种疑难病症的进程。通过揭示细胞亚群中独特的免疫生物标志物,推动免疫疗法及靶向治疗迈向更精准、个性化的发展阶段。

2021-12-15

沼液生产单细胞蛋白饲料研究中获进展

 厌氧消化是有机废弃物资源化利用的重要技术,而含有高浓度氨氮的沼液处理是沼气和生物天然气产业发展的难题。沼液利用和处理方式有作为肥料还田利用和当作废水达标处理排放。沼液中的氨氮来自于有机废弃物中的蛋白氮,蛋白氮来自于种植阶段使用的肥料氮,而肥料氮是合成氨厂花费大量天然气能源将空气中的氮气转化得到的氮化合物,若采用硝化-反硝化的方式处理沼液,将氨氮转

2021-12-03

Nature Immunology:提出抗原特异性CD8+T细胞的高通量、高维度单细胞分析方法

 抗原特异性对T细胞功能至关重要,但由于技术局限,其在T细胞高通量多组学分析中常常被忽略。美国德克萨斯大学奥斯汀分校的研究团队揭示了一种用于抗原特异性CD8+T细胞的高通量、高维度单细胞分析方法。该研究成果于近日发表在《Nature Immunology》上,题为:High-throughput and high-dimensional singl

2021-12-11

研究人员发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM

  近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cancers为题在国际学术期刊Nucleic

2021-12-03

单细胞转录组研究难治性多发性骨髓瘤亚克隆特异性微环境影响和药物反应

随着时间的推移,几乎所有的多发性骨髓瘤患者对治疗都会变得毫无反应。复发性/难治性多发性骨髓瘤(RRMM)伴随着骨髓瘤细胞的克隆性进化,并伴有异质性基因组畸变和骨髓微环境的深刻改变。然而,导致耐药性的分子机制仍然难以捉摸。

2021-12-09