清华大学生命学院杨雪瑞课题组开发深度学习工具DeepLinc，使用单细胞空间转录组数据构建细胞互作网络
DeepLinc针对单细胞空间转录组数据，提出新的方法理论，通过新型深度学习模型的创新应用，挖掘细胞分子特征谱图与复杂生理与病理组织之间的多层级复杂关联，充分释放单细胞空间组学分析的优势与潜力。
2022-06-13
Nature Biotechnology :提出单细胞多组学数据整合与调控推断新方法
基因的转录在生物学中心法则中处于承上启下的重要环节，与相对“静态”的基因组相比，转录组在不同组织/器官/发育阶段均有显著变化，是细胞完成相应生理/病理功能的重要生物学基础。
2022-05-20
Science：构建出迄今为止最为庞大的多种人类器官的单细胞图谱
除了极少数例外，我们每个人身体里的数万亿个细胞都携带着基本相同的人类基因组，每个人类基因组包含2万到2.5万个蛋白编码基因。
2022-05-19
南海所首次完成斑节对虾单细胞基因图谱构建
近日，中国水产科学研究院南海水产研究所李运东博士等人成功完成斑节对虾单细胞测序，构建了首个斑节对虾单细胞基因图谱，为对虾抗逆机制的遗传解析提供了重要理论依据。相关研究成果发表在Frontiers
2022-05-14
Science：构建出人类跨组织单核RNA测序细胞图谱
理解和治疗疾病需要对不同的细胞及其在人类组织和器官中的相互作用进行深入、系统的描述，同时也需要对导致疾病风险的遗传变异进行表征。
2022-05-16
Science：利用单细胞RNA测序揭示系统性红斑狼疮的细胞类型特异性分子关联和遗传关联
系统性红斑狼疮（SLE）是一种异质性的自身免疫性疾病，在女性和亚洲、非洲和西班牙血统的人中发病率较高。bulk转录组分析表明，1型干扰素信号的增加、淋巴细胞激活失调和细胞凋亡清除的失败是这种疾病的标志
2022-04-10
Nature子刊: 单细胞测序揭示受体介导的癌症精准联合治疗
个性化肿瘤学带来了希望，即每个患者的癌症都可以根据其基因组特征进行治疗。几项试验表明，有可能以足够快的速度收集基因组数据，为治疗决策提供信息。对2011-2013年间完成的I期临床试验的荟萃分析显示，总的来说，使用分子生物标记物信息来影响治疗计划的试验比没有使用分子生物标志物信息的试验结果更好。
2022-03-30
Science：利用单细胞eQTL定位确定自身免疫性疾病的细胞类型特异性基因控制
人类的免疫系统已经进化到通过调节专门的细胞群体来维持组织稳态和靶向外源性病原体。它在不同个体之间显示出巨大的差异，决定了人们对疾病易感性和对病原体或癌症的反应是如何不同。
2022-04-09