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Nat Method:单细胞分辨率下对细胞信号交流进行分析的多实例学习模型-Spacia

Spacia模型能够帮助研究者从各种生物学样品的单细胞空间转录组数据中获得新的知识。

2024-09-06

研究揭示海洋巨型单细胞多核钙化藻基因组异源多倍化与生物钙化机制

针对仙掌藻和脆叉节藻的钙化模式的差异,该研究揭示了仙掌藻胞外钙化和脆叉节藻次级细胞壁钙化的遗传调控特征。

2024-10-04

Nature:单细胞多组学研究揭示唐氏综合征儿童易患白血病的原因

这项单细胞多组学研究为唐氏综合征胎儿造血提供了高分辨率分子图谱,并表明唐氏综合征患者细胞基因组中存在显著的调节重构,从而导致他们易患白血病等血液学疾病。

2024-10-03

Cell:樊荣团队开发全球首个临床级福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本的空间全转录组测序技术

在约2300种已知的人类成熟microRNA中,Patho-DBiT在MALT切片中检测到了1352种microRNA,其映射序列的长度峰值为21个核苷酸,与此类小RNA的已知长度完全一致。

2024-10-04

Nat Methods:瞿昆/黎斌/陈发来合作系统性评估单细胞多组学分析算法

结果显示,在蛋白质丰度预测方面,totalVI 和 scArches 表现最为优异;在染色质可及性预测中,LS_Lab 算法排名领先。

2024-10-02

Cancer Cell:复旦大学曹志伟/陈海泉团队绘制小细胞肺癌空间单细胞图谱,揭示其空间分子异质性及免疫互作生态位

该研究通过空间多组学揭示了非小细胞肺癌的肿瘤异质性和免疫微环境动态,提出了 MT2 生态位作为患者预后和免疫治疗响应的新标志,为小细胞肺癌的精准分型和治疗策略提供了重要依据。

2025-02-26

——全球首份单细胞图谱揭示治疗新方向

那些反复流产的绝望、5倍飙升的子宫内膜癌风险,根源竟不是卵巢,而是我们从未真正读懂的子宫内膜!

2025-03-23

Nat Cancer:王红阳/陈磊团队绘制肝细胞单细胞分辨率空间原位蛋白图谱,揭示肝细胞癌微环境空间异质性

利用CODEX技术,研究人员对401名HCC患者的肿瘤样本进行36种抗体染色,分辨率达0.377 μm/pixel,一共获得了4,347,731个细胞,定义了72个细胞表型以及40个细胞邻域关系。

2024-10-03

韩欣欣/蔡春晖/邓玮等开发类器官新技术,从单细胞悬浮液培养出大小一致的卵巢癌类器官

该研究为开发量身定制的治疗策略开辟了一条有前景的道路,特别是在肿瘤研究领域,针对卵巢癌治疗的细微差别量身定制治疗策略。

2024-08-16

Science:利用单细胞染色质可及性图谱揭示原发性人类癌症中的恶性调控程序

多种人类原发性癌症类型的 TCGA 单细胞图谱和用于解释癌症中顺式调控元件的可解释深度学习模型,为了解导致原发性人类癌症恶性表型的分子程序提供了新的资源。

2024-09-27