Nat Cancer:王红阳/陈磊团队绘制肝细胞癌单细胞分辨率空间原位蛋白图谱,揭示肝细胞癌微环境空间异质性
利用CODEX技术,研究人员对401名HCC患者的肿瘤样本进行36种抗体染色,分辨率达0.377 μm/pixel,一共获得了4,347,731个细胞,定义了72个细胞表型以及40个细胞邻域关系。
Nat Methods:scNanoSeq-CUT&Tag技术:可精准检测单细胞基因组复杂区域的染色质修饰
该研究开发了一种基于单分子测序平台的 scNanoSeq-CUT&Tag 新方法,可以精准检测单个细胞内染色质修饰特征,包括组蛋白修饰和转录因子的结合分布模式。
Science:利用单细胞染色质可及性图谱揭示原发性人类癌症中的恶性调控程序
多种人类原发性癌症类型的 TCGA 单细胞图谱和用于解释癌症中顺式调控元件的可解释深度学习模型,为了解导致原发性人类癌症恶性表型的分子程序提供了新的资源。
Exp Mol Med:新方法或能将普通的成纤维细胞转化为成熟的心肌细胞从而有效修复心脏损伤
本文研究强调了JAK2–STAT3信号通路在激活TGFB信号通路和ECM合成从而直接重编程心肌细胞中所扮演的关键角色。
解析细胞内的“工作分配”Cell:新方法捕捉蛋白在病毒感染时的“职场变迁”
研究人员的新方法将特定蛋白视为细胞器、其液体内部(细胞质)和其他内部结构的组成部分,而不是一次一个地精确定位特定蛋白的位置。
Cell子刊:井然等人揭示增强iPSC-CAR-T细胞抗肿瘤效果新方法
组蛋白赖氨酸甲基转移酶G9a/GLP是T细胞命运的抑制因子,化学抑制G9a/GLP能够诱导人iPSC来源的CAR-T细胞的成熟和持久性,从而产生更强、更持久的抗肿瘤活性。
单细胞数据的双刃剑!Cell:新研究指出人类scRNA-seq 数据集存在隐私泄露风险,应加强保护
利用不同实验室生成的数据,甚至用不同方法处理的数据,然后用它来将完全不同的匿名数据集中的个体关联起来,这种能力相当惊人,而且凸显了单细胞数据的真正隐私问题。
Nature:科学家首次绘制出人类产前皮肤的单细胞蓝图,揭秘人类产前皮肤的奇妙世界
来自纽卡斯尔大学等机构的科学家们通过研究首次创建了人类产前皮肤的单细胞图谱,旨在理解人类皮肤是如何形成的以及在疾病发生中所出现的问题。
Sci Signaling:科学家发现能在细胞水平上饿死前列腺癌肿瘤的新方法
本文研究强调了营养压力期间GCN2和p53调节之间的协调相互作用,并为揭示其之间的相互作用是如何被靶向作用从而开发针对人类前列腺癌的新型疗法提供了新的研究见解。
Nature:儿童T细胞急性淋巴细胞白血病的多组学分析
这项研究通过分析 T 细胞急性淋巴细胞白血病的多组学数据,确定了15种亚型,并揭示了非编码区域基因组改变和增强子失调机制在疾病发展中的关键作用。