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细胞应激颗粒中的mRNA确实可以表达蛋白

2020年12月16日讯/生物谷BIOON/---就像人一样,细胞也会遭受应激。突然的氧气下降、过热或毒素都会引发一连串的分子变化,导致细胞停止生长,产生应激保护因子,并形成应激颗粒(stress granule)---蛋白和RNA分子挤在一起形成的无膜细胞器。虽然应激颗粒的功能在很大程度上仍然是未知的,但人们认为它们只含有不被翻译成蛋白的RNA。如今,一项

2020-12-16

Cell:对埃博拉病毒进行单细胞研究,揭示了这种病毒的致命策略

2020年11月15日讯/生物谷BIOON/---埃博拉病毒是世界上最致命的病原体之一。如今,在一项新的研究中,来自美国国家卫生研究院(NIH)、布罗德研究所、麻省理工学院和斯坦福大学等研究机构的研究人员报告了埃博拉病毒在感染过程中如何改变宿主免疫反应以有利于自己的新细节。他们鉴定出这种病毒抑制的抗病毒防御基因,以及这种病毒激活的其他基因,以便潜在地促进它在

2020-11-15

研究开发出基于深度学习的单细胞转录组分析模型

  单细胞转录组作为单个细胞的特征,可更加精确地定义细胞的类型。常规的基于单细胞转录组的分类方法首先是进行无监督的聚类,然后根据每个集群(Cluster)特异表达的细胞标记基因来对集群进行标注。虽然基于无监督的分类方法更容易发现新细胞类型,但是人工标注的过程费时费力。目前已有的基于监督学习的自动分类方法,大部分无法兼顾到方法的可解释性以及

2020-11-12

Immunity:新技术可帮助修复单细胞RNA测序的丢失数据

从单个细胞中测序RNA可以揭示有关这些细胞在体内做什么的大量信息。麻省理工学院的研究人员现在通过修改常用的Seq-Well技术,大大提高了从每个细胞收集的信息量。

2020-10-15

单细胞测序找到背后原因

 黑色素瘤是最为致命的皮肤癌类型,且发病率不低——根据美国癌症学会的统计,每38名白种人里,就有1人会在生命中的某一时刻罹患黑色素瘤。如果发现得早,这种恶性肿瘤还可以通过手术切除。一旦它发生扩散,治疗手段就会大受局限。但要早期发现黑色素瘤并非易事。在很多人的意识里,黑色素瘤来源于痣的恶化。然而事实上,这只能解释部分黑色素瘤的起源。大部分黑色素瘤在发

2020-10-08

中国科学家首次解析神经母细胞单细胞

 神经母细胞瘤(NB)是神经-衍生的恶性肿瘤的一种亚型,是儿童时期最常见的颅外实体瘤。尽管进行了广泛的研究,NB的潜在发展起源仍不清楚。2020年9月17日,复旦大学研究团队在Cancer Cell 在线发表题为“Glial Metabolic Rewiring Promotes Axon Regeneration and Functional R

2020-10-16

Genome Med:单细胞RNA测序技术或能揭示胰腺肿瘤中单个细胞的特性 有望帮助开发个体化胰腺癌疗法

2020年10月11日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在国际杂志Genome Medicine上的研究报告中,来自美国翻译基因组学研究院等机构的科学家们通过研究详细描述了组成胰腺癌微环境的单个细胞的特性,这或许有望帮助开发新型疗法来治疗这种侵袭性且难以治疗的癌症类型。图片来源:CC0 Public Domain文章中,研究人员利用一种名为单细胞

2020-10-11

科学家们成功在单细胞分辨率下解析机体肠道神经系统的奥秘!

2020年9月29日 讯 /生物谷BIOON/ --整个胃肠道系统中嵌入的是一种更为广泛的神经元阵列,其会协调几乎所有的活动,包括消化、肠道运动以及对有害刺激的反应等,这些细胞就组成了肠道神经系统(ENS,enteric nervous system),并能将信号传输到大脑中,但其非常稀少且很脆弱,很难进行分离和深入研究,近日,一项刊登在国际杂志Cell上题

2020-09-29

科学家开发出高通量检测单细胞mRNA动态变化的新技术scNT-seq

 细胞命运转变以及响应外界信号的过程中会改变细胞类型特异(cell-type-specific)的基因表达,而基因表达的丰度(total RNA level)是由mRNA转录、加工、降解等过程共同决定的。在含有多种细胞类型的复杂组织和系统中,在单细胞水平准确测定这些 mRNA动态变化过程对于理解基因表达调控的重要性不言而喻。传统的mRNA代谢标记技

2020-09-03

Cell Rep:单细胞测序预测化疗的有效性

在最近一项研究中,来自密歇根大学的Jun Hee Lee博士课题组使用一种单细胞RNA测序的技术,首次展示了单个癌细胞群中的各个细胞对化学疗法引起的DNA损伤的基因表达差异。他们发现,这些反应可以被分为三类:激控制细胞死亡,细胞分裂或应激反应。相关结果发表在最近的《Cell Reports》杂志上。

2020-08-26