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Advanced Science:韩敬东团队开发转录数据空间重构新算法

该研究建立了一种单细胞/寡细胞转录组数据从头空间重构算法——De Novo Coalescent Embedding(D-CE)。该研究利用细胞-细胞转录相关网络的非线性嵌入方法,从头重构了单细胞转录

2023-06-21

单细胞转录测序,揭示动物发育过程“古老”和“年轻”基因的表达模式

这一研究揭示了不同细胞类型在转录组年龄上的显著差异,有助于对不同细胞的进化起源进行估计,为理解驱动物种进化的遗传机制提供了新的视角

2023-05-17

空间转录数据多模态可视化工具研究取得进展

目前已有工具可以将二维切片的基因表达模式进行可视化,或者进一步堆叠多张切片并形成组织的三维静态视图,但在三维空间中对空间转录组数据的分子特征和空间形态进行交互式探索仍然是一个难点。

2023-06-05

科学家开发出用于肝癌特异性筛查的基因cfDNA片段化特征检测方法

肝癌的发病率和死亡率在癌症中位居前列,全世界每年新增病例超过90万,死亡病例超80万。在所有肝癌病例中,肝细胞癌 (HCC)占比约90%,对肝细胞癌高危人群进行有效、高灵敏度的筛查显得尤为重要。目前对

2023-06-25

Nature Cancer:基因CRISPR筛选,发现多发性骨髓瘤治疗新靶点

研究团队筛选到了一组几乎全新且独特的影响多发性骨髓瘤细胞脆弱性的基因,筛选到的这116个对多发性骨髓瘤生存至关重要的基因中只有少数在此前寻找多发性骨髓瘤基因突变或基因表达改变的研究中被发现。

2023-06-01

Cell子刊:基因测序揭示贝多芬死亡之谜

这项研究的主要目标是揭示贝多芬的健康问题,包括广为人知的他从20多岁开始逐渐丧失听力,直至完全失聪。通过提取和分析贝多芬头发的基因组,并没有找到他耳聋和肠胃问题的确切原因,但发现了他携带了一些肝脏疾病

2023-03-24

Nature Aging:揭示调控灵长类器官衰老的表观转录机制

该研究揭示了三种重要的灵长类器官/组织在生理性衰老过程中的动态m6A修饰变化及其与基因表达稳态的关系,并阐释了METTL3–m6A–NPNT通路维持人类骨骼肌稳态的作用和机制。

2023-04-11

Nature Aging:刘光慧团队等揭示调控衰老的表观转录时钟

该研究系统揭示了三种重要的灵长类器官/组织在生理性衰老过程中的动态m6A修饰变化及其与基因表达稳态的关系,并且深入阐明了METTL3–m6A–NPNT通路维持人类骨骼肌稳态的作用和机制。

2023-04-10

Nature重磅:樊荣团队率先实现表观遗传-转录联合分析

除了成功实现整个领域期待的在同一组织样品上实现总体染色质可及性和基因表达的联合空间组学分析(Spatial ATAC–RNA-seq),该研究还同时报道了三个特定的组蛋白修饰和基因表达的联合分析

2023-03-16

《自然·衰老》:海马单细胞转录学研究,全面揭示APOE4促进阿尔茨海默病发生机制

阿尔茨海默病(AD)是一种多见于老年人的神经系统退行性疾病。正如影视作品中所描述的这样,随着疾病的进展,患者逐渐忘记周围的人,忘记自己引以为傲的过去,失去丰沛的感情,最终丧失生活能力。

2023-03-13