Nat Biotech:华大基因等单位完成谷子基因组测序
2012年5月14日,由深圳华大基因研究院和张家口市农业科学院等单位合作完成的谷子基因组研究成果于国际著名杂志《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)上在线发表。在本研究中,科研人员成功构建了谷子全基因组序列图谱,为揭示谷子抗旱节水、丰产、耐瘠和高光合作用效率等生理机制的研究提供了新的途径,并为高产优质、抗逆谷子新品种的培育奠定了坚实的基础。
Cell:通过基因组测序预测膜蛋白的三维结构
膜蛋白的存在使细胞与胞外环境或细胞与细胞之间的“交流”得以实现。超过25%的人类蛋白拥有完整的膜结构域,这些蛋白中许多在医学上非常重要,因为几乎一半的药物靶点都包含一个膜结构域。通过膜蛋白的三维结构可以描述它的分子机制和加速以它为靶点的药物分子的研发。 尽管解析蛋白结构的方法有了很大进步,但大部分膜蛋白的三维结构还是未知的。有效而精确的预测膜蛋白三维结构的计算方法将是现存实验方法的重要补充。
Nat Commun:马氏正钳蝎基因组测序完成
11月2日,武汉大学传出消息:由该校领衔并与上海生物信息技术研究中心合作,在国际上首次完成了全球生物量最大的蝎种——马氏正钳蝎(俗称东亚钳蝎)的基因组测序,由此揭示了蝎子这种独特的节肢动物适应模式。 该研究成果10月15日在线发表于《自然—通讯》(国际权威杂志《自然》子刊之一),武大李文鑫教授与中科院上海生命科学研究院李亦学研究员、李轩研究员是共同通讯作者。
Sci Transl Med:免疫组库测序平台助力免疫疗法功效预测
Sequenta公司近期宣布,与加州大学旧金山分校和加州大学洛杉矶分校研究人员,使用该公司专有的LymphoSIGHT免疫组库测序平台研究了抗CTLA-4抗体对癌症病人血液中T细胞数量和类型的影响。
Nature:遗传变异和转录组
Christopher Glass及同事对近亲繁殖的小鼠世系之间自然出现的遗传变异加以利用,将其作为一个诱变策略,来研究负责巨噬细胞中顺式调控要素的选择和功能的分子机制。
Nat Commun:桑树基因组测序完成
数千年来,家蚕只以桑叶作为唯一的食物。为了探索二者之间的联系,日前,《自然—通讯》杂志在线发表了西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室完成的桑树全基因组测序成果。 据了解,桑树基因组测序由中国工程院院士向仲怀、西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室牵头,集合了浙江省农业科学院、广东省农业科学院、中国林业科学研究院等单位,历时3年完成。
绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱完成
据国家烟草专卖局官方网站报道,绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱已经由中国烟草完成。这是全球第一套烟草全基因组序列图谱,也是继马铃薯和番茄基因组之后全球完成的第三种茄科植物全基因组序列图谱。该绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱是目前已知植物基因组序列图谱中基因组最大、组装精度最高、组装结果最好的2个图谱。
Cell:英国完成一种传染性癌症基因组的测序
近日,来自英国Sanger研究院,Illumina Cambridge公司等处的研究人员完成了一种传染性癌症的基因组测序,并从中发现了一些突变,解析了这种癌症的来源,以及如何变得具有传染性的。相关论文发表在2月17日的《细胞》(Cell)杂志上。
Genome Res:科学家对耐药细菌进行全基因组测序来预测细菌毒力
来自英国巴斯大学的研究人员通过对MRSA进行全基因组测序来预测其毒力,这为开发治疗MRSA感染的个体化疗法提供了一定的帮助和希望。