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美国利用纳米孔测序技术,实现对非洲猪瘟病毒基因组的实时检测

 非洲猪瘟病毒(ASFV)是非洲猪瘟病毒科家族的唯一成员,是一种大型(200nM)复杂的囊膜双链DNA病毒。ASFV可感染家猪和野猪,扩散快,致死率高(可达100%),对猪业造成严重的经济后果。近期,美国农业部下属的研究机构在Journal of Clinical Microbiology杂志上发表了针对非洲猪瘟病毒的首个结合样品富集、纳米孔Min

2020-11-13

非洲病原体基因组计划正式启动,获Illumina、Oxford Nanopore等多家机构投资

 近日,非洲疾病控制与预防中心及非洲联盟委员会联合启动了一项病原体基因组计划(Pathogen Genomics Initiative , PGI),旨在通过配备工具、培训和数据基础设施的跨大陆综合实验室网络,充分利用关键的基因组测序技术,增强病原体疾病监测和公共卫生合作。目前,这项为期四年的测序项目已获得高达1亿美元的资金支持,资金来源包括比尔和

2020-11-13

Nature:继2003年和2011年后 美国国家人类基因组研究所再发布人类基因组研究领域美好新愿景!

2020年11月3日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature上的研究报告中,来自美国国家人类基因组研究所(NHGRI)等机构的科学家们发表了他们在基因组前言研究领域改善人类健康的战略愿景,这一愿景描述了未来十年人类基因组学研究中最引人注目的研究重点和研究机遇,这标志着这一研究领域或有望进入一个新的研究时代。研究者Eric Gree

2020-11-03

中国水产科学研究院珠江所叶星研究员团队发布首个大口黑鲈染色体水平基因组图谱

 近日,珠江水产研究所叶星研究员团队完成了大口黑鲈染色体水平基因组精细图谱的绘制和遗传解析,研究论文“Chromosome-level genome assembly for the largemouth bassMicropterus salmoidesprovides insights into adaptation to fresh and

2020-11-11

利用纳米孔测序研究人体组织样本等位基因效应对转录结构的影响

 不同的组织和个体之间的基因表达和调控的差异很大,大部分的常见复杂性状相关的基因组通过假定表达和剪接机制来发挥作用,如10%的致病突变都具有已知的剪接效应,RNA测序则能够很好的分析等位基因特异性并解读遗传变异。迄今为止的大多数RNA测序研究都使用短读长RNA测序技术;由于短读长容易出现多重定位的情况,因此很难确定异构体的来源,同时会给定量带来干扰

2020-11-19

Nat Med:科学家成功利用宏基因组测序技术快速识别人类体液中的病原体

2020年11月16日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature Medicine上的研究报告中,来自加利福尼亚大学等机构的科学家们通过研究发现,利用宏基因组测序技术(metagenomic sequencing)或能快速检测人类体液样本中的病原体,文章中,研究人员描述了他们如何对多种人群开展宏基因组测序检测,其中大部分人群都是因病

2020-11-16

研究发现细胞套亡通过p53信号对抗上皮细胞基因组不稳定性新机制

 有丝分裂(mitosis)是动物细胞的基本分裂形式,该过程受到严格调控,以保证产生正常子代细胞,进而维持细胞的更新换代和人体的生长发育。当有丝分裂发生异常时,通常会激活细胞纺锤体组装检查点(spindle assemble checkpoint, SAC)【1】,延缓有丝分裂以修复异常。然而,一些细胞会“逃过”该监视过程分裂产生非整倍体子代细胞(

2020-11-10

Cell:基因组CRISPR筛选鉴定出对新冠病毒感染至关重要的宿主因子

2020年10月31日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国耶鲁大学和布罗德研究所等研究机构的研究人员对暴露于SARS-CoV-2和MERS-CoV冠状病毒的数亿个细胞进行了筛选,鉴定出几十个能使这两种病毒在细胞中复制的基因,也鉴定出一些似乎抑制这些病毒的基因。他们表示,这些基因的促病毒作用和抗病毒作用将有助于指导科学家们开发新的疗法来对抗C

2020-10-31

Mol Cell:SARS-CoV-2或能利用“基因组折纸技术”来感染宿主细胞并进行复制

2020年11月9日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,发表在国际杂志Molecular Cell上的一篇研究报告中,来自剑桥大学和吉森大学的科学家们通过研究揭示了SARS-CoV-2如何利用基因组折纸技术(genome origami)来成功感染宿主细胞并在其中进行复制,相关研究结果或有望帮助开发靶向作用病毒基因组特殊部位的有效药物,从而治疗COVID-

2020-11-09