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研究人员预测和设计揭示无序蛋白结构域的靶标识别机制

中国科大刘海燕教授、陈泉教授课题组与复旦大学王文宁教授合作,采用蛋白质结构预测、序列设计等计算手段与蛋白质互补分析和深度突变扫描、X射线晶体学、NMR等实验结合的方法,揭示了固有无序的4.1G蛋白C端

2023-10-07

Nature:解析出FAM122A 和 ARPP19 与磷酸酶 PP2A:B55 结合在一起时的三维结构

我们体内的细胞会不断分裂和更新。但如果细胞分裂出现问题,就会导致癌症或其他疾病。如今,在一项新的研究中,来自美国康涅狄格大学的研究人员发现了两种难以捉摸的对细胞健康分裂至关重要的蛋白。

2024-01-22

华人科学家开发出DVAP打印方法,可让超声波油墨凝固成不同的三维形状和结构

在一项新的研究中,来自美国杜克大学和哈佛医学院的研究人员开发出一种生物相容性油墨(bio-compatible ink),它能通过吸收超声波凝固成不同的三维形状和结构。由于这种油墨对声波而非光线有反应

2023-12-20

Science:揭示核糖核苷酸还原酶在自由基状态下的三维结构

尽管 DNA 在生物学中发挥着基础性作用,而且半个世纪以来对它进行了大量研究,但 DNA的构成单元(building block)是如何形成的许多方面仍不清楚。如今,在一项新的研究中,来自瑞典斯德哥尔

2023-10-16

Nature:利用新开发的 Foldseek Cluster算法一次性分析大量的蛋白结构

在一项新的研究中,来自瑞士苏黎世联邦理工学院、瑞士生物信息学研究所和韩国首尔国立大学等研究机构的研究人员通过开发一种有效的方法来比较 AlphaFold 数据库中的所有预测蛋白结构,揭示了不同物种蛋白

2023-09-27

Redox Biology: 人类NADPH氧化酶中电子转移机制所需的一个以前未被认识到的结构特征

极早发病(VEO)炎症性肠病(IBD)是儿童炎症性肠病(IBD)中发病率上升的一个亚组,受强烈的遗传影响,包括与原发免疫缺陷相关的遗传变异。

2023-10-26

Nature子刊:复旦大学马剑鹏团队开发智能算法,大幅提升冷冻电镜蛋白结构解析分辨率

作为蛋白质结构预测领域顶尖团队,由诺贝尔奖得主 Micheal Levitt 教授和马剑鹏教授领导的复旦大学复杂体系多尺度研究院,聚焦基础科学、交叉学科及源头底层技术,致力于推动生物大分子结构实验测定

2023-10-13

上海交大邓子新团队受邀撰写NPR封面文章——迭代式Ⅰ型聚酮合酶的结构酶学

尽管在近20年里,人们对于type I iPKSs的研究取得了长足的进展,但其复杂多变的编程式催化现象依然难以预测。然而,基于人工智能的Alphafold2

2023-10-03

Nature子刊:百图生科宋乐团队开发新型蛋白质结构预测工具,不依赖多序列对比,效率更高

与基于MSA的的主流蛋白质结构预测工具AlphaFold2和RoseTTAFold方法相比,HelixFold-Single在预测效率上具有很大优势,耗时要少得多,可以应用于需要大量预测的蛋白质相关任

2023-10-17

Science:我国科学家从结构上揭示CAF-1参与核小体组装机制

细胞分裂过程中的染色质遗传涉及 DNA 的复制和核小体在复制的 DNA 上的组装,因为 DNA 复制叉的通过会破坏 DNA 上的核小体。这种DNA复制偶联的核小体组装(DNA replication-

2023-09-08