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美吉生物 I-Sanger生信云RNA-Seq 2.0上线

“大数据、云计算、免费”这些在互联网行业司空见惯的字眼,在生物行业被一家基因测序公司(美吉生物)掀起了一阵巨浪,??将云平台与高通量测序完美结合,为生物信息学的发展带来了无限可能,推动科研服务带入2.0时代。美吉生物 I-Sanger生信云自上线以来得到了科研用户的广泛好评,用户无需配置Linux操作系统,安装复杂的分析软件,下载大量的数据库,只需在I-Sanger生信云平台中选择相应的分析流程和

2017-06-12

Journal of Leukocyte Biology:揭示鞭毛素调节呼吸道DC功能 并增强IgA抗体应答的细胞和分子机制

近日,免疫学专业期刊《白细胞生物学杂志》(Journal of Leukocyte Biology)在线发表题为《鼻腔上皮细胞通过TLR5/GM-CSF调节呼吸道DC并增强IgA应答》(Nasal epithelial GM-CSF contributes to TLR5-mediated modulation of airway dendritic cells and subsequent Ig

2017-06-01

Nature:高亲和性IgA抵抗肠道微生物感染机制

疫苗诱导的高亲和力的IgA能够通过中和细菌分泌的毒性因子起到清除肠道病原菌感染的作用。此外,IgA还能够通过破坏细菌与肠道组织的相互作用来完成这一使命。此前研究表明,IgA能够介导肠道病原菌发生交联反应,形成

2017-04-13

利用Perturb-Seq和CRISP-Seq大规模平行分析数以万计基因扰动

多亏两种高度类似的技术:一种技术是由美国布罗德研究所的Aviv Regev和同事们开发出的,该技术被称作Perturb-Seq;另一种技术是由以色列魏兹曼研究所的Ido Amit和同事们开发出的,该技术被称作CRISP-Seq。在一项实验中,利用Perturb-Seq、CRISP-Seq或将这两种技术结合在一起研究众多基因扰动是可能的。

2017-03-28

Nat Methods:开发出基于CRISPR/Cas9和单细胞RNA测序的CROP-seq方法

在一项新的研究中,来自奥地利科学院CeMM分子医学研究中心的Christoph Bock及其团队开发出一种新方法:将CRISPR集中筛选和按序筛选(arrayedscreen)的优势结合在一起。通过将CRISPR基因组编辑与单细胞RNA测序整合在一起,他们在单个实验中研究上千个细胞,从而能够平行地确定多种基因的调控影响。

2017-01-23

Science:开发出TT-Seq技术绘制人类瞬时转录组图谱

在一项新的研究中,研究人员开发出一种TT-Seq方法可以用于发现活跃的可控制基因活性的调节性DNA序列。

2016-06-04

解读单细胞RNA-seq技术

多年来,跟踪一个单细胞的转录组,超出了我们的能力。但是现在,时代已经变了,新的单细胞RNA-seq方法,可以分析大量的细胞及它们的命运。我们都参加过大型生日派对:在拥挤的房间里,与许多人聊天、吃饭和庆祝。但

2015-03-26

Nature Methods发布重磅结果:新测序技术——Ribose-seq

核糖核苷酸是RNA的基本单位,它们会在DNA复制和修复过程中嵌入基因组DNA,进而影响基因组的稳定性。然而,迄今为止人们还无法鉴定和定位这些插入DNA的核糖核苷酸。

2015-03-26

:余学清等发现IgA肾病新的易感基因

近期,在《自然-遗传学》(Nature Genetics)上发表研究报告"A genome-wide association study in Han Chinese identifies multiple susceptibility loci for IgA nephropathy"称:完成了基于汉族人群IgA肾病全基因组易感基因筛查研究。

2012-11-18

系统比较RNA-Seq基因谱

BioRxiv最新收录的文章通过对不同RNA-Seq研究工具的比较来分析哪些工具更胜任转录组研究工作。

2014-05-27