MIT最新研究：从氨基酸链片段直接预测蛋白质功能
就在几个月前，DeepMind推出了AlphaFold系统，这个被称为生物界“AlphaGo”的系统能够预测并生成蛋白质3D结构。而近日，来自MIT的研究人员开发了一个新的研究模型，能够直接预测氨基酸链片段是如何决定蛋白质功能的。这一发现可以帮助研究人员设计和测试新的蛋白质，从而用于药物研发和生物学研究。我们都知道，蛋白质是维持我们生命所必需的庞大而复杂的物质。蛋白质具体能完成什么样的
Genetics：嵌套CRISPR利用长片段进行高效的基因组编辑
2019年2月14日讯/生物谷BIOON/---CRISPR是一种通过高精度基因组编辑引发生物医学研究变革的技术。然而，即使它允许相对容易地产生或校正由单个或几个核苷酸组成的突变，在对基因组中较大DNA片段进行编辑时，它仍然存在着限制。比如，将产生荧光蛋白（比如广泛使用的绿色荧光蛋白）的基因插入到基因组中具有较低的效率，而且涉及复杂的克隆步骤。在一项新的研究中，西班牙Bellvitge生物医学研究
剑桥科学家发现循环肿瘤DNA片段大小特征，更灵敏地检测早期肿瘤或成现实
从2016年FDA批准首个基于EGFR基因突变的液体活检产品，到今年8月bTMB被证实可以预测免疫治疗的效果，液体活检已在肿瘤治疗领域大放异彩。不幸的是，血液中的肿瘤循环DNA分子含量通常远远低于血液中非癌症相关DNA的片段，这使得检测它们非常困难，特别是在癌症的早期阶段。今天，英国剑桥大学科学家Nitzan Rosenfeld带领的团队，终于为液体活检打开了封印。他们发现
Nature：对人胚胎进行CRISPR/Cas9基因编辑会导致大片段DNA缺失
2018年8月10日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自澳大利亚阿德莱德大学、南澳大利亚健康与医学研究所、拉筹伯大学、新加坡-麻省理工技术研究联盟和美国天普大学的研究人员发现了实现胚胎基因编辑潜在益处的一个重大障碍。相关研究结果发表在2018年8月9日的Nature期刊上，论文标题为“Large deletions induced by Cas9 cleavage”。论文通信作者为阿德
首次破解人cGAS的三维结构，揭示它为何识别长片段DNA同时忽略短片段DNA
2018年7月23日/生物谷BIOON/---人体是为生存而建造的。人体中的每一个细胞都受到一组免疫蛋白的严密保护，而且这些免疫蛋白装备了几乎万无一失的雷达来检测外来的或受损的DNA。人细胞中的一个最为关键的哨兵是一种被称作cGAS的“第一响应者”蛋白，它检测外来的和发生癌变的DNA的存在，并启动一种信号级联反应，从而触发身体防御。2012年蛋白cGAS的发现引发了科学探究的风暴，迄今为止，科学家
Nat Biotechnol：厄运不断，CRISPR/Cas9基因编辑竟导致大片段DNA缺失和重排
2018年7月18日/生物谷BIOON/---在几天前的一项研究中，来自美国伊利诺伊大学芝加哥分校的研究人员发现在利用CRISPR/Cas9进行基因编辑遭遇失败（大约在15％的时间发生）时，这通常是由于Cas9蛋白持续地结合到DNA上，这会阻止DNA修复酶进入切割位点（详情参见生物谷新闻报道：Mol Cell：揭示CRISPR/Cas9基因编辑为何有时会遭遇失败）。科学家们已将CRISPR基因编辑
FSI Genetics：新工具可从未知个体的DNA片段预测出该个体的眼睛、毛发和皮肤颜色！
2018年5月18日讯 /生物谷BIOON /—最近，一个由美国印第安纳大学科学院和荷兰鹿特丹Erasmus MC大学医学中心的科学家领导的国际团队开发出了一种新工具，该工具能从犯罪现场或考古遗迹等场景中获得的人类生物样本--即使是很小的DNA样本--中准确预测出样本所有者的眼睛、头发和皮肤的颜色。这种一体化的色素分析工具采用的是一种前所未有的方式，通过一个开放获取的网络工具将三种色素的特性集合在
DNA片段预测肾脏移植手术成功率
2018年2月7日 讯 /生物谷BIOON/ --在最近一项研究中，来自英国的科学家们发现了能够预测肾脏移植成功率的关键基因特征。这项研究首次针对英国以及爱尔兰的肾脏移植手术数据进行了分析，发现受体移植效果最佳（即长期生存几率最高）的亚群符合受-供体特殊DNA片段（HLA）一致的特征。这一发现或许能够帮助提高肾脏移植个体化医疗的水平，减少患者的治疗成本以及花费的时间。（图片摘自www.pixaba
PLoS Negl Trop Dis：蚊子tRNA片段帮助其扩散疾病
2018年1月25日 讯 /生物谷BIOON/ -- tRNA是负责蛋白合成的关键原件，而根据最近发表在《PLOS Neglected Tropical Diseases》杂志上的一篇文章，转运RNA片段（tRNA fragments）对于蚊子来说有着另外的作用。很多种不同类型的RNA分子，包括microRNA，siRNA以及最近发现的tRF分子，对于健康与疾病都有重要的意义。它们能够直接与DNA
Nature：从结构上揭示MHC-I肽组装复合体筛选蛋白片段机制
图片来自S. Trowitzsch, A. Möller, R. Tampé。2017年11月16日/生物谷BIOON/---如今，社交媒体帮助我们跟上时事。由于我们无法同时处理大量的信息，神经网络仅提取我们需要知道的信息。我们体内的细胞以一种类似的方式运作：在抵抗寄生虫、病毒甚至癌症的过程中，一种被称作MHC-I肽组装复合体（MHC-I peptide-loading complex）