Nat Biotechnol：DNA重复片段——基因组中的“黑物质”
2019年11月25日 讯 /生物谷BIOON/ -- 基因组的大部分区域由重复片段组成。这些“ DNA重复序列”在错误位置的扩增可能会产生严重后果。然而，DNA重复序列的扩增非常难以分析。柏林马克斯·普朗克分子遗传学研究所的研究人员最近开发的一种方法可以详细查看这些以前无法进入的基因组区域。它结合了纳米孔测序，干细胞和CRISPR-Cas技术。该方法可以改善未来各种先天性疾病和癌症的诊断。&nb
利用三代变异检测技术研究番茄驯化位点一个重复片段中和了一种影响番茄育种障碍的隐秘变异
第三代测序技术崛起了，伴随而来的三代变异检测技术也成为发现大片段结构变异的新宠儿，从2016年医学研究人员首次用 PacBio 测序技术找到致病性结构变异成功诊断罕见疾病，到2018年中信湘雅生殖与遗传专科医院的研究人员采用 Nanopore 测序技术精确诊断出一段长达 7Kb 的缺失突变并明确了结构变异的来源，再到2019年利用 PacBio 测序技术系统揭示人类基因组中结构变异的特
CRISPR编辑系统升级 利用“跳跃基因”精确插入DNA片段
顶尖学术期刊《科学》最新上线发表的一篇论文中，Broad研究所、麻省理工学院McGovern脑研究所的张锋教授与其同事带来了一款全新的CRISPR基因编辑工具，利用“跳跃基因”，让DNA片段插入基因组变得更加容易。大肠杆菌中的实验结果显示成功率达到80%，远高于经典CRISPR系统。革命性的基因编辑工具CRISPR/Cas系统实现了在基因组特定位点进行精准编辑。不过，以经典
Nature：新型基因片段有望帮助开发抵御癌症和自身免疫性疾病的新型疗法
2019年6月11日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一篇发表在国际杂志Nature上的研究报告中，来自德州农工大学的科学家们通过研究发现，人类基因STING（干扰素基因的刺激子）的一小片段或是治疗自身免疫性疾病和癌症的关键。文章中，研究者发现，一种特定的蛋白质基序或能帮助科学家们开发新型药物，来抑制引发自身免疫性障碍的人类机体未知免疫反应。图片来源：en.wikipedia.orgSTING
MIT最新研究：从氨基酸链片段直接预测蛋白质功能
就在几个月前，DeepMind推出了AlphaFold系统，这个被称为生物界“AlphaGo”的系统能够预测并生成蛋白质3D结构。而近日，来自MIT的研究人员开发了一个新的研究模型，能够直接预测氨基酸链片段是如何决定蛋白质功能的。这一发现可以帮助研究人员设计和测试新的蛋白质，从而用于药物研发和生物学研究。我们都知道，蛋白质是维持我们生命所必需的庞大而复杂的物质。蛋白质具体能完成什么样的
Genetics：嵌套CRISPR利用长片段进行高效的基因组编辑
2019年2月14日讯/生物谷BIOON/---CRISPR是一种通过高精度基因组编辑引发生物医学研究变革的技术。然而，即使它允许相对容易地产生或校正由单个或几个核苷酸组成的突变，在对基因组中较大DNA片段进行编辑时，它仍然存在着限制。比如，将产生荧光蛋白（比如广泛使用的绿色荧光蛋白）的基因插入到基因组中具有较低的效率，而且涉及复杂的克隆步骤。在一项新的研究中，西班牙Bellvitge生物医学研究
剑桥科学家发现循环肿瘤DNA片段大小特征，更灵敏地检测早期肿瘤或成现实
从2016年FDA批准首个基于EGFR基因突变的液体活检产品，到今年8月bTMB被证实可以预测免疫治疗的效果，液体活检已在肿瘤治疗领域大放异彩。不幸的是，血液中的肿瘤循环DNA分子含量通常远远低于血液中非癌症相关DNA的片段，这使得检测它们非常困难，特别是在癌症的早期阶段。今天，英国剑桥大学科学家Nitzan Rosenfeld带领的团队，终于为液体活检打开了封印。他们发现
Nature：对人胚胎进行CRISPR/Cas9基因编辑会导致大片段DNA缺失
2018年8月10日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自澳大利亚阿德莱德大学、南澳大利亚健康与医学研究所、拉筹伯大学、新加坡-麻省理工技术研究联盟和美国天普大学的研究人员发现了实现胚胎基因编辑潜在益处的一个重大障碍。相关研究结果发表在2018年8月9日的Nature期刊上，论文标题为“Large deletions induced by Cas9 cleavage”。论文通信作者为阿德
首次破解人cGAS的三维结构，揭示它为何识别长片段DNA同时忽略短片段DNA
2018年7月23日/生物谷BIOON/---人体是为生存而建造的。人体中的每一个细胞都受到一组免疫蛋白的严密保护，而且这些免疫蛋白装备了几乎万无一失的雷达来检测外来的或受损的DNA。人细胞中的一个最为关键的哨兵是一种被称作cGAS的“第一响应者”蛋白，它检测外来的和发生癌变的DNA的存在，并启动一种信号级联反应，从而触发身体防御。2012年蛋白cGAS的发现引发了科学探究的风暴，迄今为止，科学家
Nat Biotechnol：厄运不断，CRISPR/Cas9基因编辑竟导致大片段DNA缺失和重排
2018年7月18日/生物谷BIOON/---在几天前的一项研究中，来自美国伊利诺伊大学芝加哥分校的研究人员发现在利用CRISPR/Cas9进行基因编辑遭遇失败（大约在15％的时间发生）时，这通常是由于Cas9蛋白持续地结合到DNA上，这会阻止DNA修复酶进入切割位点（详情参见生物谷新闻报道：Mol Cell：揭示CRISPR/Cas9基因编辑为何有时会遭遇失败）。科学家们已将CRISPR基因编辑