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Nat Commun:利用人工智能技术和机器人系统结合来识别隐藏的帕金森疾病特征

来自美国的科学家们通过研究开发了一种能帮助发现疾病细胞特征的新平台,其或能将研究患者细胞的机器人系统与进行成像分析的人工智能方法相结合,利用这种自动化的细胞培养平台,研究人员通过创建并分析来自91名患者和健康对照个体的超过100万个皮肤细胞图像,成功识别出了帕金森疾病的新型细胞标志。

2022-03-31

揭示DNA结合蛋白高效结合DNA靶序列的新机制

2022年1月28日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自瑞典乌普萨拉大学的研究人员展示了DNA结合蛋白如何在不受到阻碍的情况下在整个基因组中搜索它的靶序列。这一结果与我们目前对基因调控的理解------遗传密码影响DNA结合蛋白的结合频率,但不影响它的结合时间---相矛盾。相关研究结果发表在2022年1月28日的Science期刊上,论文标题为

2022-01-28

Nature:科学家构建基因表达调控DNA序列进化和适应度景观研究框架

 顺式作用元件是位于基因旁侧序列中能影响基因表达的非编码DNA序列。这些顺式作用元件的突变可能影响与基因转录因子相互作用,从而调控基因表达,进而改变生物表型和适应度景观。一个完整的适应度景观由一个适应度函数定义,该函数将序列空间中的每个序列映射到其相关的适应度。但调控DNA序列与适应度建立的映射关系很难可靠地推广到整个序列空间,因此构建完全的适应度

2022-03-24

Nature Machine Intelligence:发现基于Transformer的多肽-HLA I类结合预测和疫苗的新生抗原序列设计

  近日,国际知名期刊《Nature Machine Intelligence》在线发表了上海交通大学生命科学技术学院魏冬青团队的研究论文《A transformer-based model to predict peptide–HLA class I binding and optimize mutated peptides for v

2022-03-25

Nature Genetics:科学家发现DNA复制叉移动速度是细胞命运变化的基础

细胞的全能性在早期胚胎发育中出现,但其分子基础的特征仍不明显。德国慕尼黑大学的研究团队发现,DNA复制叉移动速度是细胞命运变化的基础,并促进细胞重编程。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》上,题为:DNA replication fork speed underlies cell fate changes and promotes rep

2022-03-20

熬夜破坏癌症相关基因节律,促进DNA损伤并降低修复效率,增加癌症风险

越来越多的证据表明,夜班工作者中癌症更为普遍,这也促使了世界卫生组织(WHO)国际癌症研究机构在2019年将夜班工作归类为“可能对人类致癌”。但夜班工作究竟为何会增加癌症风险,现在仍不清楚。此外,当代年轻人熬夜现象越来越严重,因为加班、玩游戏、刷短视频等等,主动或被动熬夜已成为许多人的新常态。熬夜是否如夜班工作一样增加癌症风险?美国华盛顿州立大学的研究人员在

2022-03-15

 小分子抑制剂靶向E2泛素结合酶UbcH5c抑制胰腺癌生长和转移

胰腺癌是一种高度侵袭性的恶性肿瘤,其特点是诊断晚,治疗方法有限。根据肿瘤的可切除性,胰腺癌患者被分为四类:可切除的、边缘可切除的、局部晚期的和转移的。尽管近年来胰腺癌的早期诊断和治疗取得了一定的进展,但完整的手术切除是胰腺癌患者获得治愈的唯一途径。大多数病例(高达80%)在晚期确诊,失去手术机会。

2022-03-22

FMR1可通过结合m6a标记的mRNA来调控胚胎发育

母体RNA的降解对胚胎形成至关重要,并受到母体RNA结合蛋白的严格调控。在最早期的胚胎阶段,由于合子基因组在转录上为沉默状态,早期胚胎发育完全依赖于预先装入卵母细胞的母体因子(包括RNA和蛋白质)。而在胚胎发生的后期,胚胎发育由合子基因组新合成的基因产物调控。遗传学研究表明,很大一部分母体产物对后期的胚胎发育并不是必需的,其中一些产物

2022-03-09

Developmental Cell:揭示RNA结合蛋白相分离在植物热胁迫应答中的作用

  近日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心植物逆境生物学研究中心植物分子遗传国家重点实验室张蘅研究组与中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心刘聪研究组合作,揭示两个保守RNA结合蛋白质RBGD2(RNA-binding glycine-rich group D 2)、RBGD4通过独特的酪氨酸阵列(Tyr residue a

2022-03-11

Nat Genet:延缓DNA复制叉速度可导致细胞命运变化和增强细胞重编程效率

鉴于DNA复制叉(replication fork)的分子特性对调节DNA复制至关重要,来自德国慕尼黑大学和亥姆霍兹慕尼黑中心等研究机构的研究人员着手研究体内全能性细胞和体外培养中的全能样细胞(totipotent-like cell,即类似于全能性细胞的细胞)的复制叉动态。

2022-03-08