Science:开发出一种检测CRISPR脱靶效应的新方法---DISCOVER-Seq
2019年4月20日讯/生物谷BIOON/---自从CRISPR基因组编辑技术于2012年发明以来,它已经显示出治疗许多难治性疾病的巨大希望。然而,科学家们一直在努力在治疗相关的细胞类型中鉴定潜在的脱靶效应,这仍然是将治疗方法转移到临床应用的主要障碍。如今,在一项新的研究中,来自美国加州大学伯克利分校、加州大学旧金山分校、格拉德斯通研究所和瑞典阿斯利康公司的研究人员开发出一种可靠的方法来实现这一目
Lab on a Chip:新研究快速检测细菌耐药性的产生
2019年3月15日 讯 /生物谷BIOON/ --科学家已经开发出一种新的,更快速的测试方法,用于确定单个细菌如何对抗生素产生反应,这可能有助于抵抗抗菌素耐药性。了解药物如何影响单一细菌可以帮助临床医生更快地针对正确的抗生素,减少长期治疗的需要。目前检测细菌药物耐受性的方法是通过测试细菌在药物环境中生长及其对药物的反应得到的。然而,由于细菌生长是一个缓慢的过程,测试可能需要时间并且可能不太准确。
Lab on Chip:新型黏性机器人能够快速检测疾病
2019年2月15日 讯 /生物谷BIOON/ --人体组织会经历各种机械刺激,这些机械刺激可以影响它们执行其生理功能的能力,例如保护器官免受伤害。研究表明,在体内和体外对活组织进行相关刺激有助于病症的研究。在EPFL,Selman Sakar的研究团队开发了能够机械刺激细胞和微组织的工具。这些工具由细胞大小的人造肌肉提供动力,可以在微观尺度上在生理条件下执行复杂的操作任务。(图片来源:www.p
开发出cfMeDIP–seq技术,最低仅需1ng血浆cfDNA就可检测早期癌症
2018年11月15日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,在加拿大玛嘉烈公主癌症中心研究员Daniel De Carvalho博士的领导下,一个研究团队以血液样本作为测试对象,将“液体活检”、甲基化分析和机器学习相结合,开发出一种灵敏的基于免疫沉淀的测试方法来分析少量血浆循环游离DNA(cell-free DNA, cfDNA)中的甲基化组(methylome),从而能够在癌症的最早阶段检
Lab on a Chip:科学家开发出新型免疫疗法有望特异性地靶向杀灭肿瘤细胞
2018年11月8日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Lab on a Chip上的研究报告中,来自加利福尼亚大学的科学家们通过研究开发了一种新型的免疫筛查原型(immunotherapy screening prototype),其或许能帮助快速开发个体化的癌症疗法,来帮助临床医生有效地靶向作用肿瘤组织,同时还不会产生像其它标准癌症药物所带来的副作用。图片来源:en.wik
QB期刊 |RNA-seq数据计算方法大汇总
引言 分子生物学的中心法则自1958年由Francis Crick提出到今年正好60周年,它描述了“DNA制造RNA,RNA制造蛋白质”的遗传信息的标准流程 [1]。十年前,第二代RNA测序技术(RNA-seq)的诞生及其迅速发展使得研究者可以在对RNA序列没有任何先验信息的情况下高通量地对全转录组进行测序 [2]。现如今第二
《科学》期刊发布重磅SPLit-seq技术
许多疾病,例如阿尔兹海默病和帕金森病,都源于某些类型细胞的功能障碍。对这些类型的细胞进行深度分析、发掘致病基因,将有助于了解疾病的病因和进展情况,进而帮助开发出相应的治疗方法。通过单细胞RNA测序技术对细胞进行分类是现阶段重要的研究方向,但是现有方法价格昂贵,且需要专门的设备,严重阻碍了单细胞研究的广泛开展。近日,一项最新研究成果为单细胞测序技术带来了突破,有望将单个细胞的测序成本降至
Nat Methods:新型基因组工具CITE-seq或能实现单细胞大规模多维度分析
2017年8月3日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature Methods上的研究报告中,来自纽约基因组研究中心(NYGC)的研究人员通过研究开发了一种新技术,或能帮助推动单细胞RNA测序的进程,单细胞RNA测序是基因组研究的重要领域,其能够帮助研究人员深入解读单细胞的特性,同时还能够帮助有效区分不同的细胞类型,以及在单细胞水平下研究多种人类疾病的发病机制。图片来源:N
美吉生物 I-Sanger生信云RNA-Seq 2.0上线
“大数据、云计算、免费”这些在互联网行业司空见惯的字眼,在生物行业被一家基因测序公司(美吉生物)掀起了一阵巨浪,??将云平台与高通量测序完美结合,为生物信息学的发展带来了无限可能,推动科研服务带入2.0时代。美吉生物 I-Sanger生信云自上线以来得到了科研用户的广泛好评,用户无需配置Linux操作系统,安装复杂的分析软件,下载大量的数据库,只需在I-Sanger生信云平台中选择相应的分析流程和
利用Perturb-Seq和CRISP-Seq大规模平行分析数以万计基因扰动
多亏两种高度类似的技术:一种技术是由美国布罗德研究所的Aviv Regev和同事们开发出的,该技术被称作Perturb-Seq;另一种技术是由以色列魏兹曼研究所的Ido Amit和同事们开发出的,该技术被称作CRISP-Seq。在一项实验中,利用Perturb-Seq、CRISP-Seq或将这两种技术结合在一起研究众多基因扰动是可能的。