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Nat Methods:开发出基于CRISPR/Cas9和单细胞RNA测序的CROP-seq方法

在一项新的研究中,来自奥地利科学院CeMM分子医学研究中心的Christoph Bock及其团队开发出一种新方法:将CRISPR集中筛选和按序筛选(arrayedscreen)的优势结合在一起。通过将CRISPR基因组编辑与单细胞RNA测序整合在一起,他们在单个实验中研究上千个细胞,从而能够平行地确定多种基因的调控影响。

2017-01-23

Science:开发出TT-Seq技术绘制人类瞬时转录组图谱

在一项新的研究中,研究人员开发出一种TT-Seq方法可以用于发现活跃的可控制基因活性的调节性DNA序列。

2016-06-04

解读单细胞RNA-seq技术

多年来,跟踪一个单细胞的转录组,超出了我们的能力。但是现在,时代已经变了,新的单细胞RNA-seq方法,可以分析大量的细胞及它们的命运。我们都参加过大型生日派对:在拥挤的房间里,与许多人聊天、吃饭和庆祝。但

2015-03-26

Nature Methods发布重磅结果:新测序技术——Ribose-seq

核糖核苷酸是RNA的基本单位,它们会在DNA复制和修复过程中嵌入基因组DNA,进而影响基因组的稳定性。然而,迄今为止人们还无法鉴定和定位这些插入DNA的核糖核苷酸。

2015-03-26

系统比较RNA-Seq基因谱

BioRxiv最新收录的文章通过对不同RNA-Seq研究工具的比较来分析哪些工具更胜任转录组研究工作。

2014-05-27

Global Change Biol:森林土壤的“激发效应”与有机碳平衡

由于全球变暖和二氧化碳浓度增加,植物可能提高向地下土壤的碳输入,而这种输入的增加可能影响土壤中原来固持的有机碳释放,形成“激发效应”,但具体的变化规律并不十分清楚。

2013-12-06

Nature Clim Change:夏季高温热浪与北极冰雪消融有关

大气环流对北极海冰融化的响应强于对雪覆盖减少的响应。冰冻圈消融时高空急流会发生变化,即西风急流减弱并北移。

2013-12-10

Nature Climate Change :全球变暖会加强病菌传播能力

人们常担心全球变暖会导致一些本来存在于热带的病菌向其他地方扩散,新一期英国《自然—气候变化》(Nature Climate Change)杂志刊登的一份报告证实了这种现象的存在。这项研究显示,弧菌疫情在北欧的暴发与当地海洋的变暖有关。 弧菌是一类可引起肠道感染的细菌,它会引发肠胃炎和霍乱等疾病。这种细菌通常存在于较温暖的水域中,人们如果吃了不干净的水产品就可能会染病。

2012-11-18

Global Change Bio:气候变化影响雪兔-猞猁种群周期性波动

北美地区的雪兔-猞猁种群数量10年周期性波动一直是种群生态学中研究的一个热点,并且在生态学教科书中一直被用作猎物-捕食者相互作用形成种群周期振荡的经典案例。中科院动物研究所农业动物生态研究组严川等通过分析长期数据发现:一,与传统的猎物-捕食模型不同,雪兔与猞猁之间存在非对称性的猎物-捕食者效应,即雪兔对猞猁为直接正作用,而猞猁对雪兔的负作用有两年时滞;二...

2013-10-16

Nat Climate Change:二氧化碳能致鱼类反应迟缓

鱼类失去对危险的反应能力,增加了其被吃掉的可能性 近日,科学家发现海洋中的二氧化碳对鱼类的作用就像酒精所产生的效果,造成鱼类不能判断风险以及容易失去感觉。这种“中毒”症状使得全球变暖和海洋酸化对海洋生态系统的威胁加剧,相关研究结论发表在Nature Climate Change杂志上。

2012-11-18