IF=81!瘤内细菌的“突变暗器”:重庆医科大学龙泉鑫/石小枫/黄爱龙/别梦军发现NDK借IRF3之手改写肺癌基因组
这项研究揭示了“细菌效应蛋白→宿主组氨酸磷酸化→突变酶激活”的跨界信号轴,将瘤内微生物定植与肿瘤基因组进化直接相连。
Nature:揭示APOBEC3A导致肿瘤细胞对靶向疗法产生耐药性
过去二十年来,针对肿瘤中特定基因异常的癌症疗法彻底改变了治疗的可能性。虽然靶向治疗提高了生活质量和生存率,但由于对靶向治疗产生抗药性的新肿瘤细胞的进化,复发很常见。
Nature:意外!相比于APOBEC3B,APOBEC3A更可能是引发人类癌症突变的酶
在一项新的研究中,来自美国和英国的多个研究机构的研究人员发现发现了酶APOBEC3A和癌细胞系中最普遍的突变特征(mutational signature,也译为突变标签)之间的联系。
Nat Biotechnol:开发出可预测基因组编辑器脱靶活性的工具---CHANGE-seq
2020年7月19日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国圣犹大儿童研究医院、卡内基梅隆大学和美国国家标准技术局等研究机构的研究人员开发出一种易于使用的灵敏的高通量的方法,用于确定由CRISPR-Cas9等基因组编辑器引起的非预期的DNA双链断裂的位置。他们将这种方法称为CHANGE-seq(Circularization for High-
Nat Biotechnol:中科院高彩霞团队开发出针对植物的新型可预测的多核苷酸缺失系统
2020年7月19日讯/生物谷BIOON/---许多小调控元件,包括miRNA、miRNA结合位点和顺式作用元件,仅由5~24个核苷酸组成,在调控基因表达、转录和翻译、蛋白结构方面发挥着重要作用,因此是基因功能研究和作物改良的理想靶点。CRISPR-Cas9系统已在基因组工程中得到广泛应用。在这种系统中,sgRNA引导的Cas9核酸酶产生染色体双链断裂(DS
Nat Biotechnol:构建出具有自我编辑活性的DNA碱基编辑器
2019年9月21日讯/生物谷BIOON/---2016年,Komor等人利用16个碱基长的XTEN接头(XTEN linker)将大鼠胞苷脱氨酶APOBEC1与dCas9连接在一起,从而构建出第一代碱基编辑器(BE1)。BE1表现出大约5个核苷酸的活性窗口(activity window):靶位点4~8。为了增加体内编辑效率,第二代碱基编辑器(BE2)系统除了将胞苷脱氨酶与dCas9连接在一起之
PNAS:揭示人体蛋白Apobec3A抑制HIV重新激活机制
2019年1月26日/生物谷BIOON/---许多关于HIV病毒的研究都集中在预防感染上,但是很少有人了解身体如何在感染后控制这种病毒。在一项新的研究中,来自美国耶鲁大学的研究人员揭示出一种称为Apobec3A的蛋白的作用:一旦HIV入侵人体细胞,它就阻断这种病毒的基因表达。相关研究结果于2019年1月22日在线发表在PNAS期刊上,论文标题为“Apobec3A maintains HIV-1 l