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研究人员利用光催化邻近标记技术揭示应激颗粒转录组动态变化

应激颗粒是在胁迫条件下形成的动态结构,通常认为其中包含翻译被抑制的RNA以及翻译元件,并可在刺激消失后解聚,是细胞内典型的无膜细胞器。

2023-12-04

Nature子刊:颉伟/李晶团队揭示增强子在卵子发生及早期胚胎发育中的转录调控机制

研究团队鉴定了哺乳动物卵子到早期胚胎中活跃增强子网络,揭示了其不同于成体细胞的重要特征。

2024-06-09

Nature Genetics:清华大学刘念团队发现转座子LINE-1转录选择性激活远程基因表达

该研究提供了功能多样的LINE-1表达调控因子,发现并验证了LINE-1 5' UTR作为增强子在早期胚胎发育阶段通过转录依赖的方式直接与ZGA基因相互作用激活基因表达。

2024-06-11

Science:科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型

研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序,当分析了数以万计已知的人类启动子数据后,这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成,即基序、启动子和三核苷酸(trinucleotides)。

2024-05-27

Cancer Discov | 北京大学汤富酬/周鑫揭示了结直肠癌分子亚型的表观遗传基础和特征转录因子

该研究系统地揭示了著名的iCMS和CIMP分类的CRCs的表观遗传学基础。

2024-03-12

科研人员开发表观转录组数据聚类框架iMVP

iMVP的开发为RNA编辑修饰研究带来了新的可能性,为科研人员提供了一个更全面、更有效的工具,有望有助于更深入地理解RNA编辑修饰的复杂性和功能。

2023-10-13

Nature:新研究定量确定发育中的胚胎内的细胞基因活性变化的细节

在一项新的研究中,来自美国华盛顿大学的研究人员开发出一种技术,可以定量确定斑马鱼胚胎中发生的基因活性变化,这些变化是对关键基因的特定编辑做出的反应。这种方法可以定量确定数千个胚胎中数百万个细胞在发育过

2023-11-24

Cell:清华大学李寅青/李丕龙团队揭示基因表达的“保温杯”——具有相分离能力双效应转录因子

这项研究揭示了一类具有相分离能力的dual-action TFs,它们通过选择性地招募转录核心组件,实现其独特的双效转录调节功能。

2024-04-21

Nature:精神分裂症患者和老年人的脑组织中存在一系列相似的基因活性变化

在这项新研究中,McCarroll、Berretta及其同事们利用单核 RNA 测序技术测量单个细胞中的基因表达,以更好地了解大脑是如何因人而异的。

2024-03-29

J Adv Res:新型硫代氨基脲和1,2,4-三唑衍生物的合成及其驱寄生虫活性

本研究结果表明,化合物II-1在所有测试模型中都表现出体外驱虫活性。此外,计算机研究表明,活性最高的化合物II-1可能通过抑制微管蛋白聚合和SDH酶的作用模式。

2024-06-15