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科研人员开发表观转录组数据聚类框架iMVP

iMVP的开发为RNA编辑修饰研究带来了新的可能性,为科研人员提供了一个更全面、更有效的工具,有望有助于更深入地理解RNA编辑修饰的复杂性和功能。

2023-10-13

Nature Genetics:清华大学刘念团队发现转座子LINE-1转录选择性激活远程基因表达

该研究提供了功能多样的LINE-1表达调控因子,发现并验证了LINE-1 5' UTR作为增强子在早期胚胎发育阶段通过转录依赖的方式直接与ZGA基因相互作用激活基因表达。

2024-06-11

Nature:新研究定量确定发育中的胚胎内的细胞基因活性变化的细节

在一项新的研究中,来自美国华盛顿大学的研究人员开发出一种技术,可以定量确定斑马鱼胚胎中发生的基因活性变化,这些变化是对关键基因的特定编辑做出的反应。这种方法可以定量确定数千个胚胎中数百万个细胞在发育过

2023-11-24

Cancer Discov | 北京大学汤富酬/周鑫揭示了结直肠癌分子亚型的表观遗传基础和特征转录因子

该研究系统地揭示了著名的iCMS和CIMP分类的CRCs的表观遗传学基础。

2024-03-12

Science:科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型

研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序,当分析了数以万计已知的人类启动子数据后,这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成,即基序、启动子和三核苷酸(trinucleotides)。

2024-05-27

Cell:清华大学李寅青/李丕龙团队揭示基因表达的“保温杯”——具有相分离能力双效应转录因子

这项研究揭示了一类具有相分离能力的dual-action TFs,它们通过选择性地招募转录核心组件,实现其独特的双效转录调节功能。

2024-04-21

Nature子刊:汤玮欣团队开发更高活性、更好序列兼容性的腺嘌呤碱基编辑器

由于具有更宽的编辑窗口与更好的序列兼容性,ABE8r可以有效编辑其他ABEs难以编辑的疾病相关位点。

2024-01-03

Nature:精神分裂症患者和老年人的脑组织中存在一系列相似的基因活性变化

在这项新研究中,McCarroll、Berretta及其同事们利用单核 RNA 测序技术测量单个细胞中的基因表达,以更好地了解大脑是如何因人而异的。

2024-03-29

Cell Rep Med:一种新型癌症药物在多种癌症类型动物模型中或能展现出强大的抗肿瘤活性

研究开发出了一种史无前例的药物来抑制YB-1,从而就能有效抑制其发出的指令。这种药物在多种不同类型肿瘤的动物模型中都展现出强大的抗肿瘤活性,包括卵巢癌和侵袭性的乳腺癌等。

2024-06-08

Nat Biotechnol:利用真核逆转录因子蛋白将转基因插入人类安全港位点,有望开发出安全高效的基因疗法

逆转录转座子是 DNA 片段,当转录为 RNA 时,它编码的酶会将 RNA 复制到基因组的 DNA 中——这是一个自我服务的循环,这使得基因组中充斥着逆转录转座子 DNA。

2024-02-26