"女娲"基因组计划第2篇:徐涛/何顺民团队发布中国人群可移动元件插入变异图谱
可移动元件(也被称为转座子或转座元件)约占人类基因组的一半。在人类基因组中,Alu、LINE-1(L1)、SINE-VNTR-Alu(SVA)以及HERV-K等是普遍认为仍然活跃的可移动元件家族,它们能够通过转座作用在基因组上形成新的插入,这种现象被称为可移动元件插入(Mobile Element Insertion,MEI)。转座事
Nat Commun:科学家成功绘制出新型结肠基因图谱 或有望帮助阐明多种肠道疾病发生的分子机制
来自瑞典卡罗琳学院等机构的科学家们通过利用空间转录组学技术分析了小鼠结肠中的基因表达,从而创建了一种能展示单个基因在组织中表达位置的图谱,当研究人员将此前已知的人类转录数据叠加到该图谱上时,研究人员就获得了对炎性肠病的新认识。
Science:研究揭示CpG岛结合蛋白BEND3调控分化过程中二价基因转录的功能
中国科学院生物物理研究所朱冰课题组与许瑞明课题组合作,在《科学》(Science)上,在线发表了题为Highly enriched BEND3 prevents the premature activation of bivalent genes during differentiation的研究论文,报道了CpG岛结合蛋
“复旦肿瘤”科学家绘制出最大三阴性乳腺癌代谢物图谱
三阴性乳腺癌是“粉红杀手”乳腺癌的一种亚型,约占所有乳腺癌人群的15%。因恶性程度高、复发转移风险大、缺少精准治疗靶点,三阴性乳腺癌又被称为“最凶”乳腺癌。复旦大学附属肿瘤医院乳腺外科邵志敏教授、江一舟教授领衔团队成功绘制出当前世界上最大规模的三阴性乳腺癌代谢物图谱,优化了既往分型标准,为三阴性乳腺癌的精准个体化治疗提供新方向;作为三阴性乳腺癌“复旦分型”研
Human Genetics:基于机器学习建立人类遗传重组图谱取得进展
中国科学院上海营养与健康研究所李海鹏研究组等在Human Genetics上,在线发表了题为Fine human genetic map based on UK10K data set的研究论文。遗传重组是生命进化的基础,在有性生物形成配子的过程中,来自父方和母方的染色体相互交换遗传物质,从而增加了相邻基因间不同等位基因的组合,丰富了
我国科学家揭示活化转录因子4调控造血干细胞衰老的机制
造血干细胞衰老与机体的衰老密切相关,但其机制仍不清楚。近日,南方医科大学的研究团队在《Science Advances》发表了题为“Loss of ATF4 leads to functional aging-like attrition of adult hematopoietic stem cells”的文章,认为活化转录因子4(
Science:构建出血液蛋白形态图谱,鉴定出有潜力预测肝脏移植排斥的生物标志物
在一项新的研究中,来自美国西北大学等研究机构的研究人员发现体内的蛋白家族有可能预测哪些患者有可能会排斥新移植的器官,从而帮助患者做出治疗决定。这一进展标志着对特定细胞中的蛋白进行更精确研究的新时代的开始。
Science Advances:我国科学家绘制原发性肝癌高分辨率空间分子图谱
异质性是癌症预防和治疗的主要挑战。近日,我国海军军医大学的研究团队在《Science Advances》发表了题为“Comprehensive analysis of spatial architecture in primary liver cancer”的文章。研究人员对7例原发性肝癌患者的21个组织样本进行空间转录组
eLife:斑马鱼全脑转录图谱揭示神经元表型分子调控规则
eLife在线发表题为The landscape of regulatory genes in brain-wide neuronal phenotypes of a vertebrate brain的研究论文,该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、神经科学国家重点实验室、上海脑科学与类脑研究中心研究员何杰