Cell:先导编辑+AI,全面解析ATM基因所有点突变的功能
该研究利用先导编辑和深度学习对 ATM 基因所有可能的 27513 种单核苷酸突变(SNV)进行了全面功能评估,并开发了一种深度学习模型——DeepATM。
科研人员绘制图谱解析风险SNP驱动的促肿瘤机制
吕万革教授团队联合张弩教授团队系统性绘制胶质瘤功能性增强子互作图谱,解析风险SNP驱动的促肿瘤机制。本研究提供了胶质瘤增强子连接组资源,阐明了非编码变异如何重塑远程调控并推动肿瘤进展。
Nature:转录与基因组双重视角解析人脑衰老的分子轨迹
衰老并未改变细胞身份,但代谢与翻译相关的“管家基因”在40岁后普遍下调,核糖体和线粒体功能衰退,抑制性神经元活动性削弱。
Nature Methods:Paired-Damage-seq——同步解析DNA损伤与基因表达
研究人员开发了一种名为Paired-Damage-seq的全新技术,能够以前所未有的精度在单个细胞水平上同时分析氧化损伤和单链DNA损伤,并结合分析基因的表达情况。
研究解析哺乳动物脂肪酸的组织特异性合成与跨组织转运
近日,中国科学院上海有机化学研究所研究员朱正江团队利用稳定同位素示踪代谢组学技术,揭示了小鼠体内脂肪酸的组织特异性生物合成模式及其在各组织间的代谢交流。
中国学者一作Cell论文:解析细菌Kiwa系统的抗病毒防御机制
细菌和古菌进化出了多种多样的防御机制来抵御病毒(噬菌体)的侵害。例如在细菌和古菌中广泛存在的 CRISPR-Cas 系统,对该系统的研究不仅揭示了基本的生物学过程,还带来了革命性的新技术,让
上海交大研究团队面向真实语境,定量解析“非编码突变→基因表达”,助力复杂疾病研究
这项工作试图回答临床与科研界长期的两大难题:一个非编码突变,会让目标基因“上调还是下调”?影响到底有多强? 更关键的是,答案会随组织、细胞类型甚至疾病状态而改变。
SDR-seq高通量解析遗传变异对基因表达的精细调控
SDR-seq技术的出现,为我们提供了一个前所未有的新“罗盘”。它不仅能将我们精确地导航到那片森林,还能让我们直接走进每一户人家,亲眼看到他们的炉灶 (基因型) 和锅里煮着的食物 (基因表达)。
我国学者成功解析“柑橘癌症”抗病机制,并利用AI找到防治药物
该研究首次解析了柑橘抗黄龙病的核心分子机制,阐明了由 PUB21-MYC2 组成的黄龙病抗性遗传回路,并利用 AI 辅助筛选出了稳定抗病蛋白 MYC2 的双功能肽——APP3-14。