空间组学数据解析肿瘤微环境的异质图学习方法
该研究提出了名为stKeep的新模型。该模型构建了三种不同节点即细胞/spot、基因和肿瘤区域以及八种连接关系的异构图模型,用于刻画肿瘤微环境。
Cell:王迪团队合作揭示小肠双向营养供应环境塑造机体防御屏障和代谢稳态的重要规律
结果发现早餐进食窗口的缺失(而非午餐及晚餐)的喂养方式会引起肠细胞中包括胆固醇转运蛋白NPC1L1等脂质吸收基因的表达重编程,从而介导肠道对胆固醇的过度吸收进而加剧动脉粥样硬化的发展。
科学家找到肿瘤微环境特异性抗癌新靶点
MEN1基因在肿瘤生长中的作用依赖于宿主的免疫环境,通过调控肿瘤微环境中免疫细胞的浸润,表现出在不同免疫环境下的促癌和抑癌双重功能,这种现象为理解肿瘤微环境对基因功能的影响提供了新的视角。
下一代类器官——迷你结肠,准确模拟结直肠癌微环境及肿瘤发展
该研究开发出了患者来源的下一代类器官—“迷你结肠”,能够模拟结直肠肿瘤动力学,并在高分辨率下研究肿瘤原生微环境中的细胞的相互作用,这种下一代类器官提供了大量新的实验机会,在多个方向推动了癌症建模前沿。
Nature Methods:保留天然环境,精准提取膜蛋白:膜活性聚合物纳米盘(Nanodiscs)平台的革命性进展
这项基于纳米盘的膜蛋白提取平台,不仅在技术上实现了突破,也为膜蛋白研究开辟了新的方向。
Gut:上海交大/浙大团队共同揭示“点燃”胰腺癌免疫微环境的表观遗传治疗靶点!
在本次研究中,研究者们进行了专门的CRISPR-Cas9表观遗传体外筛选,结果显示,仅有敲除胰腺癌细胞的Med12,会在小鼠实验中显著影响成瘤速度和免疫微环境。
Nature Cancer:张泽民/程斯进团队解析单细胞尺度下结直肠癌肿瘤微环境分型
该研究建立了一个高质量的人类肠道组织单细胞图谱,揭示了肿瘤特异性的细胞亚型和转录组变化,为解析结直肠癌的细胞和分子机制提供了新的见解。
Sci Immuno :匡正团队发现环境因子通过HDAC3-TGFβ途径调控肠道簇细胞昼夜节律性分化调节肠道免疫
本研究通过探究HDAC3对肠道簇细胞的昼夜节律性分化增生的调控作用,揭示了表观遗传因子协同肠道菌群调控簇细胞的昼夜节律生成,以实时监测肠道环境变化以及维持肠道免疫稳态。
JHO:华山医院毛颖/杨辉团队综述胶质瘤独特免疫抑制微环境特征
胶质母细胞瘤(GBM)肿瘤细胞可以通过信号传导和遗传改变诱导局部微环境变化,恶性细胞和微环境之间的串扰对于肿瘤细胞的增殖和迁移乃至化疗耐药和免疫逃逸至关重要。
Nat Cancer | 张泽民/程斯进团队合作解析单细胞尺度下结直肠癌肿瘤微环境分型
该研究建立了一个高质量的人类肠道组织单细胞图谱,揭示了肿瘤特异性的细胞亚型和转录组变化,为解析结直肠癌的细胞和分子机制提供了新的见解。