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科研人员开发基于分子网络特征整合单细胞数据的新方法

  随着单细胞测序技术的快速发展,多个全球性的、大规模的细胞图谱项目相继启动,例如人类细胞图谱计划等。然而,把来自于不同组织、不同发育阶段或者只有很少重叠细胞类型的单细胞转录组数据集进行准确有效的整合仍然具有非常大的挑战性。因为当前整合单细胞数据的方法需要校正批次效应从而达到整合分析的目的,而上述所涉及的数据集的批次信息不清晰,利用这些方

2021-10-17

Science:头颈鳞状细胞癌的蛋白网络图谱可揭示PIK3CA突变体的药物敏感性

为了描述HNSCC的蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction, PPI)景观,来自美国加州大学圣地亚哥分校和加州大学旧金山分校的研究人员根据对HNSCC肿瘤进行的癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)分析所确定的分子通路改变来选择蛋白。另外的蛋白是根据存在复发性点突变的基因或以前发表的与HNSCC有关的基因添加的。

2021-10-01

Trends in Immunology:淋巴器官成纤维细胞网状细胞和管道网络作用

不同免疫细胞群的相互协调作用可促进识别病原体或癌细胞,并能精确协调免疫激活和免疫调节之间的平衡。这种平衡的建立和维持依赖于身体内外表面信息的有效和准确传输以及不同免疫细胞群之间的信息交流。

2021-08-19

Cell:揭示冗余模块化网络组织支持正常的大脑通信

2021年7月15日讯/生物谷BIOON/---回忆一个电话号码,或刚刚记住的路线,你的大脑将在许多区域之间积极沟通。人们认为,工作记忆(working memory)依赖于这些区域之间的互动,但这些大脑区域如何互动并正确表达记忆一直是个谜。在一项新的研究中,美国贝勒医学院神经科学助理教授Nuo Li博士和他的同事们调查了参与工作记忆的大脑区域之间的沟通性质

2021-07-15

Stem Cell Rep:三个关键基因组成的基因网络或能决定心脏细胞的生长

2021年7月29日 讯 /生物谷BIOON/ --Hand1和Hand2是两种特殊的转录因子,编码这两种转录因子的基因被敲除后会使得小鼠分别表现为左心室和右心室发育不良。长期以来,心脏疾病一直是引发全球人群死亡的主要原因,其中原因之一就是心脏的再生能力较差,从而就会导致损伤积累;科学家们推测,理解心脏如何从胚胎开始或有望帮助开发出新型疗法。近日,一篇发表在

2021-07-29

关于缓释NT-3三维微环境支持神经干细胞自组织发育为具有修复用途的神经网络组织的研究在Bioactive Materials发表

创伤性脊髓损伤可导致脊髓组织缺损,损伤处的恶劣微环境给脊髓组织的再生以及移植细胞的存活带来巨大挑战。从在脊髓损伤处移植胚胎脊髓组织起至今近三十多年来,通过其中的胚胎脊髓神经元去替换死亡的脊髓神经元,在损伤/移植处形成神经元中继器(neuronal relay)修复脊髓损伤的理念逐渐形成,并得到了验证。然而,胚胎脊髓组织移植受到伦理学限制、移植物不易获取等多方

2021-04-17

Cell Rep: 大脑细胞网络为神经元提供能量

人脑具有与神经胶质细胞一样多的神经元。这些分为四大类:小胶质细胞,星形胶质细胞,NG2胶质细胞和少突胶质细胞。少突胶质细胞主要起细胞绝缘带的作用。

2021-01-20

巨噬细胞网络维持心脏中的心肌细胞健康

2020年9月23日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自西班牙国家心血管病研究中心(CNIC)的研究人员发现一种细胞清洁系统,这是保持心脏健康的关键。这种机制使得心脏的收缩性细胞(心肌细胞)将受损的组分释放到细胞外面,形成称为exopher的颗粒。这些颗粒随后被生活在心脏内部的巨噬细胞网络摄取,这些巨噬细胞负责在它们引起心脏炎症之前将它们清除。

2020-09-23

研究发现大脑三维血管网络形成的细胞和分子机制

 8月21日,Neuron在线发表了题为《Piezo1通道介导的钙离子活动调控发育过程中大脑血管的路径选择》的研究论文,该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心、上海脑科学与类脑研究中心、中科院上海生命科学研究院神经科学国家重点实验室杜久林研究组完成。大脑发育过程中,血管的路径选择对脑血管三维网络的形成至关重要。该研究以斑马鱼为模型,发现大脑

2020-08-26

研究揭示植物体细胞胚发生的转录调控等级网络

  8月4日,国际学术期刊Developmental Cell在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员王佳伟研究组的研究论文。体细胞胚发生是指植物体细胞在特定诱导条件下,再生为胚胎并进而发育成为独立个体的过程。它是现今创制转基因作物的主要方式。体细胞胚发生的分子机理是《科学》评选的全世界最前沿125个科学问题之一,对于理解植物细

2020-08-11